Wyniki wyszukiwania

Wynik wyszukiwania

1/97
Nr opisu: 0000135919
Germline variant burden in cancer genes correlates with age at diagnosis and somatic mutation burden.
[Aut.]: T. Qing, H. Mohsen, Michał Marczyk, Y. Ye, T. O'Meara, H. Zhao, J. P. Towsend, M. Gerstein, C. Hatzis, Y. Kluger, L. Pusztai.
-Nature Commun. 2020 no. 11, s. 1-8, bibliogr. 33 poz.. Impact Factor 12.121. Punktacja MNiSW 200.000

2/97
Nr opisu: 0000137644
Immunological differences between immune-rich estrogen receptor-positive and immune-rich triple-negative breast cancers.
[Aut.]: T. O'Meara, Michał Marczyk, T. Qing, V. Yaghoobi, K. Blenman, K. Cole, V. Pelekanou, D. L. Rimm, L. Pusztai.
-JCO Precis. Oncol. 2020 no. 4, s. 767-779, bibliogr. 54 poz.. Punktacja MNiSW 20.000

3/97
Nr opisu: 0000135552
Molecular profiling for predictors of radiosensitivity in patients with breast or head-and-neck cancer.
[Aut.]: K. Drobin, Michał Marczyk, M. Halle, D. Danielsson, Anna Papież, T. Sangsuwan, A. Bendes, M.-G. Hong, U. Qundos, M. Harms-Ringdahl, P. Wersall, Joanna Polańska, J. M. Schwenk, S. Haghdoost.
-Cancers 2020 vol. 12 iss. 3, s. 1-18, bibliogr. 75 poz.. Impact Factor 6.126. Punktacja MNiSW 140.000

radiowrażliwość ; prognozowanie ; radioterapia ; rak piersi ; rak głowy i szyi ; reakcja skórna ; biomarker ; promieniowanie jonizujące ; białko osocza ; osteoradionekroza żuchwy ; radioterapia spersonalizowana ; skutki uboczne radioterapii

radiosensitivity ; prediction ; radiotherapy ; breast cancer ; skin reaction ; biomarker ; ionizing radiation ; plasma protein ; mandibular osteoradionecrosis ; personalized radiotherapy ; radiotherapy side effects

4/97
Nr opisu: 0000137624
Multi-omics investigation of innate navitoclax resistance in triple-negative breast cancer cells.
[Aut.]: Michał Marczyk, G. A. Patwardhan, J. Zhao, R. Qu, X. Li, V. B. Wali, A. K. Gupta, M. M. Pillai, Y. Kluger, Q. Yan, C. Hatzis, L. Pusztai, V. Gunasekharan.
-Cancers 2020 vol. 12 iss. 9, s. 1-23, bibliogr. 74 poz.. Impact Factor 6.126. Punktacja MNiSW 140.000

navitoclax ; lekooporność ; terapia raka ; oznaczenie ; multi-omika ; potrójnie ujemny rak piersi

navitoclax ; drug resistance ; cancer therapy ; signature ; multi-omics ; triple-negative breast cancer

5/97
Nr opisu: 0000136582
Technical validity of a customized assay of sensitivity to endocrine therapy using sections from fixed breast cancer tissue.
[Aut.]: R. Lau, L. L. Du, E. Chen, C. Fu, R. Gould, Michał Marczyk, B. V. Sinn, R. Layman, I. Bedrosian, V. Valero, W. F. Symmans.
-Clin. Chem. 2020 vol. 66 iss. 7, s. 934-945, bibliogr. 36 poz.. Impact Factor 7.292. Punktacja MNiSW 140.000

6/97
Nr opisu: 0000130365
BatchI: Batch effect Identification in high-throughput screening data using a dynamic programming algorithm.
[Aut.]: Anna Papież, Michał Marczyk, Joanna Polańska, Andrzej Polański.
-Bioinformatics 2019 vol. 35 iss. 11, s. 1885-1892, bibliogr. 36 poz.. Impact Factor 5.610. Punktacja MNiSW 200.000

7/97
Nr opisu: 0000130528
Gene set enrichment for reproducible science: comparison of CERNO and eight other algorithms.
[Aut.]: Joanna Żyła, Michał Marczyk, T. Domaraszewska, S. H. E. Kaufmann, Joanna Polańska, J. Weiner.
-Bioinformatics 2019 vol. 35 iss. 24, art. no. btz447 s. 5146-5154, bibliogr.. Impact Factor 5.610. Punktacja MNiSW 200.000

8/97
Nr opisu: 0000132860
Lung cancer survival and comorbidities in lung cancer screening participants of the Gdańsk screening cohort.
[Aut.]: M. Ostrowski, Michał Marczyk, R. Dziedzic, M. Jelitto-Górska, T. Marjański, S. Pisiak, T. Jędrzejczyk, Joanna Polańska, T. Zdrojewski, B. Wojtyniak, W. Rzyman.
-Eur. J. Pub. Health 2019 vol. 29 iss. 6, s. 1114-1117. Impact Factor 2.391. Punktacja MNiSW 100.000

9/97
Nr opisu: 0000131004
Pre-analytical effects of FFPE extraction methods on targeted and whole transcriptome sequencing assays for endocrine sensitivity in metastatic breast cancer.
[Aut.]: Michał Marczyk, C. Fu, R. Lau, L. Du, A. J. Trevarton, B. V. Sinn, R. E. Goould, W. F. Symmans, C. Hatzis.
-Cancer Res. 2019 vol. 79, suppl. iss. 4, abstract no. P4-08-20 s. 1
Zawiera streszczenia referatów z: 2018 San Antonio Breast Cancer Symposium; 2018 Dec 4-8, San Antonio, TX. Philadelphia

10/97
Nr opisu: 0000130998
Targeting loss of isoenzyme diversity as a novel therapeutic strategy in breast cancer.
[Aut.]: Michał Marczyk, V. Gunasekharan, V. B. Wali, W. Shi, G. Patwardhan, T. Quing, L. Pusztai, C. Hatzis.
-Cancer Res. 2019 vol. 79, suppl. iss. 4, abstract no. P3-06-09, s. 1, bibliogr. 2 poz.
Zawiera streszczenia referatów z: 2018 San Antonio Breast Cancer Symposium; 2018 Dec 4-8, San Antonio, TX. Philadelphia

11/97
Nr opisu: 0000134534
The impact of RNA extraction method on accurate RNA sequencing from formalin-fixed paraffin-embedded tissues.
[Aut.]: Michał Marczyk, C. Fu, R. Lau, L. Du, A. J. Trevarton, B. V. Sinn, R.E. Gould, L. Pusztai, C. Hatzis, W. F. Symmans.
-BMC Cancer 2019 vol. 19, art. no. 1189 s. 1-12, bibliogr. 35 poz.. Impact Factor 3.150. Punktacja MNiSW 100.000

ekstrakcja RNA ; RNA sekwencjonowanie ; FFPE ; tkanka utrwalona w parafinie ; test diagnostyczny

RNA extraction ; RNA sequencing ; FFPE ; formalin-fixed paraffin-embedded tissue ; clinical assay

12/97
Nr opisu: 0000127035
GaMRed - adaptive filtering of high-throughput biological data.
[Aut.]: Michał Marczyk, Roman Jaksik, Andrzej Polański, Joanna Polańska.
-IEEE/ACM Trans. Comput. Biol. Bioinformat. 2018 in press, s. 1-10, bibliogr. 20 poz.. Impact Factor 2.896. Punktacja MNiSW 30.000

filtrowanie informacji ; rozkład mieszaniny Gaussa ; wysokoprzepustowe dane biologiczne

information filtering ; Gaussian mixture decomposition ; high throughput biological data

13/97
Nr opisu: 0000117556
Initializing the EM algorithm for univariate gaussian, multi-component, heteroscedastic mixture models by dynamic programming partitions.
[Aut.]: Andrzej Polański, Michał Marczyk, M. Pietrowska, P. Widlak, Joanna Polańska.
-Int. J. Comput. Methods 2018 vol. 15 no. 1, art. 1850012 s. 1-21, bibliogr.. Impact Factor 1.221. Punktacja MNiSW 25.000

mieszanina Gaussa ; algorytm EM ; programowanie dynamiczne ; widmo masowe

gaussian mixture ; EM algorithm ; dynamic programming ; mass spectrum

14/97
Nr opisu: 0000127241
Serum lipid profile can discriminate between early lung cancer patients and healthy participants of a lung cancer screening program.
[Aut.]: K. Jelonek, M. Roś-Mazurczyk, M. Pietrowska, Michał Marczyk, Joanna Polańska, R. Dziadziuszko, J. Jassem, W. Rzyman, P. Widłak.
W: XXIInd Gliwice Scientific Meetings 2018, Gliwice, November 16-17, 2018. [B.m.] : [b.w.], 2018, s. 32

15/97
Nr opisu: 0000132763
Single-cell sequencing - new data, new challenge.
[Aut.]: Michał Marczyk, C. Hatzis, Joanna Polańska.
W: XI Symposium of Polish Bioinformatics Society, September 5-7, 2018, Wrocław, Poland. Book of abstracts. [B.m.] : [b.w.], 2018, s. 23

16/97
Nr opisu: 0000121886
Automated detection of lymphocytes in whole slide histopathological images using MiMSeg2 approach.
[Aut.]: Franciszek Eugeniusz* Binczyk, Michał Marczyk, Joanna Polańska.
W: XXIst Gliwice Scientific Meetings 2017, Gliwice, November 17-18, 2017. [B.m.] : [b.w.], 2017, s. 68

17/97
Nr opisu: 0000120754
Frontiers of signal processing.
[Aut.]: Michał Marczyk, Joanna Polańska, Andrzej Polański.
W: 2017 3rd International Conference on Frontiers of Signal Processing (ICFSP 2017), September 6-8, 2017 Paris, France. Ed. Krzysztof Szczypiorski. Piscataway : Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, s. 39-43, bibliogr. 19 poz.. Punktacja MNiSW 15.000

model mieszaniny ; spektrometria mas ; modelowanie matematyczne ; detekcja wartości szczytowych ; proteomika

mixture model ; mass spectrometry ; mathematical modelling ; peak detection ; proteomics

18/97
Nr opisu: 0000121158
Improving peak detection by Gaussian mixture modeling of mass spectral signal.
[Aut.]: Michał Marczyk, Joanna Polańska, Andrzej Polański.
W: 2017 3rd International Conference on Frontiers of Signal Processing (ICFSP 2017), September 6-8, 2017 Paris, France. Ed. Krzysztof Szczypiorski. Piscataway : Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2017, s. 39-43, bibliogr. 19 poz.. Punktacja MNiSW 15.000

spektrometria mas ; modelowanie matematyczne ; model mieszaniny ; detekcja wartości szczytowych ; proteomika

mass spectrometry ; mathematical modeling ; mixture model ; peak detection ; proteomics

19/97
Nr opisu: 0000115805
Mixture modeling of 2-D gel electrophoresis spots enhances the performance of spot detection.
[Aut.]: Michał Marczyk.
-IEEE Trans. Nanobiosci. 2017 vol. 16 iss. 2, s. 91-99, bibliogr. 31 poz.. Impact Factor 2.158. Punktacja MNiSW 25.000

dwuwymiarowa elektroforeza żelowa ; model mieszaniny gaussowskiej ; wykrywanie plamek

2D gel electrophoresis ; gaussian mixture model ; spot detection

20/97
Nr opisu: 0000121958
New method for efficient filtering of 2D gel electrophoresis images.
[Aut.]: Michał Marczyk.
W: XXIst Gliwice Scientific Meetings 2017, Gliwice, November 17-18, 2017. [B.m.] : [b.w.], 2017, s. 116

21/97
Nr opisu: 0000117964
Processing 2D gel electrophoresis images for efficient gaussian mixture modeling.
[Aut.]: Michał Marczyk.
W: 11th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics. PACBB 2017, Porto, Portugal, 21-23 June 2017. Eds. F. Fdez-Riverola, M. Mohamad, M. Rocha, J. De Paz, T. Pinto. Cham : Springer, 2017, s. 35-42, bibliogr. 12 poz. (Advances in Intelligent Systems and Computing ; vol. 616 2194-5357)

dwuwymiarowa elektroforeza żelowa ; filtrowanie obrazu ; modelowanie mieszaniny

2D gel electrophoresis ; image filtering ; mixture modeling

22/97
Nr opisu: 0000116612
Ranking metrics in gene set enrichment analysis: do they matter?.
[Aut.]: Joanna Żyła, Michał Marczyk, J. Weiner, Joanna Polańska.
-BMC Bioinformatics 2017 vol. 18, s. 1-12, bibliogr. 46 poz.. Impact Factor 2.213. Punktacja MNiSW 35.000

GSEA ; metryki rankingowe ; analiza ścieżki ; genomika funkcjonalna

GSEA ; ranking metrics ; pathway analysis ; functional genomics

23/97
Nr opisu: 0000117969
Reproducibility of finding enriched gene sets in biological data analysis.
[Aut.]: Joanna Żyła, Michał Marczyk, Joanna Polańska.
W: 11th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics. PACBB 2017, Porto, Portugal, 21-23 June 2017. Eds. F. Fdez-Riverola, M. Mohamad, M. Rocha, J. De Paz, T. Pinto. Cham : Springer, 2017, s. 146-154, bibliogr. 22 poz. (Advances in Intelligent Systems and Computing ; vol. 616 2194-5357)

funkcjonalna analiza wzbogaceń ; wzbogacenia zbiorów genowych ; analiza ścieżek sygnałowych ; reproduktywność

functional enrichment ; gene set analysis ; pathway analysis ; reproducibility

24/97
Nr opisu: 0000120655
Serum lipid profile discriminates patients with early lung cancer from healthy controls.
[Aut.]: M. Ros-Mazurczyk, K. Jelonek, Michał Marczyk, Franciszek Eugeniusz* Binczyk, M. Pietrowska, Joanna Polańska, R. Dziadziuszko, J. Jassem, W. Rzyman, P. Widlak.
-Lung Cancer 2017 vol. 112, s. 69-74, bibliogr. 54 poz.. Impact Factor 4.486. Punktacja MNiSW 35.000

wczesne wykrywanie ; lipidomika ; badania przesiewowe raka płuc ; spektrometria mas ; biomarkery surowicy

early detection ; lipidomics ; lung cancer screening ; mass spectrometry ; serum biomarkers

25/97
Nr opisu: 0000122289
Spatial feature selection for finding biomarkers using imaging mass spectrometry data.
[Aut.]: Michał Marczyk, Tomasz Smejkal.
W: Proceedings of the twenty third National Conference on Applications of Mathematics in Biology and Medicine, Jugowice, 11-15 September 2017. Eds.: Urszula Foryś, Jarosław Śmieja. Institute of Automatic Control. Silesian University of Technology, Faculty of Mathematics, Informatics and Mechanics. Institute of Applied Mathematics and Mechanics. Gliwice : Institute of Automatic Control. Silesian University of Technology, 2017, s. 123-129, bibliogr. 9 poz.

26/97
Nr opisu: 0000118021
Stage I non-small-cell lung cancer: long-term results of lobectomy versus sublobar resection from the Polish National Lung Cancer Registry.
[Aut.]: R. Dziedzic, W. Żurek, T. Marjański, P. Rudziński, T. Orłowski, W. Sawicka, Michał Marczyk, Joanna Polańska, W. Rzyman.
-Eur. J. Cardio-Thoracic Surg. 2017 vol. 52 iss. 2, s. 363-369, bibliogr. 21 poz.. Impact Factor 3.504. Punktacja MNiSW 30.000

lobotomia ; rak płuca ; segmentektomia

lobectomy ; lung cancer ; segmentectomy ; sublobar resection ; wedge resection

27/97
Nr opisu: 0000114238
Discovering new biologically relevant pathways by gene set enrichment analysis.
[Aut.]: Joanna Żyła, Michał Marczyk, Joanna Polańska.
W: XXth Gliwice Scientific Meetings 2016, Gliwice, November 18-19, 2016 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2016, s. 102, bibliogr. 2 poz.
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2016.pdf [dostęp 3 marca 2017]

28/97
Nr opisu: 0000110134
Improved detection of 2D gel electrophoresis spots by using Gaussian mixture model.
[Aut.]: Michał Marczyk.
W: Bioinformatics research and applications. 12th International Symposium, ISBRA 2016, Minsk, Belarus, June 5-8, 2016. Proceedings. Eds.: Anu Bourgeois, Pavel Skums, Xiang Wan, Alex Zelikovsky. Berlin : Springer, 2016, s. 284-294, bibliogr. 14 poz.

dwuwymiarowa elektroforeza żelowa ; wykrywanie plamek ; model mieszaniny gaussowskiej

2D gel electrophoresis ; spot detection ; gaussian mixture model

29/97
Nr opisu: 0000097787
Influence of genetic background and oxidative stress response on risk of mandibular osteoradionecrosis after radiotherapy of head and neck cancer.
[Aut.]: D. Danielsson, K. Brehwens, M. Halle, Michał Marczyk, A. Sollazzo, Joanna Polańska, E. Munck-Wikland, A. Wojcik, S. Haghdoost.
-Head Neck 2016 vol. 38 iss. 3, s. 387-393, bibliogr. 31 poz.. Impact Factor 3.376. Punktacja MNiSW 45.000

serum 8-okso-dG ; mutacja GSTP1 ; MTH1 ; radioterapia ; rs 1695 ; głowa i szyja ; popromienna martwica kości ; stres oksydacyjny

serum 8-oxo-dG ; GSTP1 mutation ; MTH1 ; radiotherapy ; rs 1695 ; head and neck ; osteoradionecrosis ; oxidative stress

30/97
Nr opisu: 0000114226
Methods for filtering 2D gel electrophoresis images.
[Aut.]: Michał Marczyk.
W: XXth Gliwice Scientific Meetings 2016, Gliwice, November 18-19, 2016 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2016, s. 63
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2016.pdf [dostęp 3 marca 2017]

31/97
Nr opisu: 0000107864
Prognostic value of 5-microRNA based signature in T2-T3N0 colon cancer.
[Aut.]: M. Bobowicz, M. Skrzypski, P. Czapiewski, Michał Marczyk, A. Maciejewska, M. Jankowski, A. Szulgo-Paczkowska, W. Zegarski, R. Pawłowski, Joanna Polańska, W. Biernat, J. Jaśkiewicz, J. Jassem.
-Clin. Exp. Metastasis 2016 vol. 33 iss. 8, s. 765-773, bibliogr. 50 poz.. Impact Factor 3.144. Punktacja MNiSW 35.000

mikroRNA ; rak jelita grubego ; przerzut nowotworowy ; marker prognostyczny ; miR-1300 ; miR 939

microRNA ; colon cancer ; metastasis ; prognostic marker ; miR 1300 ; miR 939

32/97
Nr opisu: 0000107384
Sensitivity, specificity and prioritization of gene set analysis when applying different ranking metrics.
[Aut.]: Joanna Żyła, Michał Marczyk, Joanna Polańska.
W: 10th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics. Eds. Mohd Saberi Mohamad, Miguel P. Rocha, Florentino Fdez-Riverola, Francisco J. Dominguez Mayo, Juan F. De Paz. Cham : Springer, 2016, s. 61-69, bibliogr. 14 poz. (Advances in Intelligent Systems and Computing ; vol. 477 2194-5357)

ranking metrics ; functional enrichment efficiency ; gene set analysis

33/97
Nr opisu: 0000114244
Serum lipid profile as a biomarker of early lung cancer: decreased levels of lysophosphatidylcholines in serum of cancer patients.
[Aut.]: M. Roś-Mazurczyk, M. Pietrowska, K. Jelonek, Michał Marczyk, Joanna Polańska, R. Dziadziuszko, J. Jassem, W. Rzymian, P. Widłak.
W: XXth Gliwice Scientific Meetings 2016, Gliwice, November 18-19, 2016 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2016, s. 112
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2016.pdf [dostęp 3 marca 2017]

34/97
Nr opisu: 0000107286
Serum mass profile signature as a biomarker of early lung cancer.
[Aut.]: P. Widlak, M. Pietrowska, Joanna Polańska, Michał Marczyk, M. Ros-Mazurczyk, R. Dziadziuszko, J. Jassem, W. Rzyman.
-Lung Cancer 2016 vol. 99, s. 46-52, bibliogr. 44 poz.. Impact Factor 4.294. Punktacja MNiSW 35.000

wczesne wykrywanie ; badania przesiewowe raka płuc ; spektrometria masowa ; proteomika ; biomarkery surowicy

early detection ; lung cancer screening ; mass spectrometry ; proteomics ; serum biomarkers

35/97
Nr opisu: 0000103797
Analysis of factors that have impact on adjuvant chemotherapy application in operated stage IIA-IV non-small cell lung cancer patients.
[Aut.]: K. Leśniewski-Kmak, T. Marjański, W. Żurek, Michał Marczyk, Joanna Polańska, W. Rzyman.
-J. Thorac. Oncol. 2015 vol. 10 iss. 9, suppl. 2, s. S678
Referat wygłoszony na: 16th World Conference on Lung Cancer, 6-9 September 2015, Denver, Colorado, USA. Impact Factor 5.040. Punktacja MNiSW 40.000

niedrobnokomórkowy rak płuc ; chemioterapia uzupełniająca

non-small cell lung cancer ; adjuvant chemotherapy

36/97
Nr opisu: 0000103919
Biomarkers Discovery by Gaussian mixture modeling and permutation tests in Imaging Mass Spectrometry Data.
[Aut.]: Grzegorz Drążek, Michał Marczyk, Joanna Polańska.
W: 9th Central and Eastern European Proteomics Conference. CEEPC 2015, Poznań, 15-18.06.2015. [B.m.] : [b.w.], 2015, s. 14

37/97
Nr opisu: 0000103798
Components of serum peptidome can differentiate between healthy controls and patients with early stage lung cancer.
[Aut.]: P. Widlak, M. Pietrowska, Joanna Polańska, Michał Marczyk, R. Dziadziuszko, W. Rzyman.
-J. Thorac. Oncol. 2015 vol. 10 iss. 9, suppl. 2, s. S491
Referat wygłoszony na: 16th World Conference on Lung Cancer, 6-9 September 2015, Denver, Colorado, USA. Impact Factor 5.040. Punktacja MNiSW 40.000

38/97
Nr opisu: 0000103920
Different approaches to detection and quantification of spectral peaks in mass spectrometry imaging data.
[Aut.]: Michał Marczyk, Grzegorz Drążek.
W: 9th Central and Eastern European Proteomics Conference. CEEPC 2015, Poznań, 15-18.06.2015. [B.m.] : [b.w.], 2015, s. 13

39/97
Nr opisu: 0000114932
Efficient algorithm for Gaussian mixture modeling of 1D biological spectra.
[Aut.]: Michał Marczyk, Andrzej Polański, M. Pietrowska, P. Widlak, Joanna Polańska.
W: VII Konwersatorium Chemii Medycznej oraz VIII Sympozjum PTBI, Lublin, 17-19.09.2015. Polskie Towarzystwo Chemii Medycznej, Polskie Towarzystwo Bioinformatyczne, Uniwersytet Medyczny w Lublinie. Lublin : Perfekta info, 2015, s. 84, bibliogr. 3 poz.

40/97
Nr opisu: 0000099362
Identifying batch effects in high-throughput biological data using dynamic programming based approach.
[Aut.]: Anna Papież, Michał Marczyk, Andrzej Polański, Joanna Polańska.
W: 19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology. RECOMB 2015, Warsaw, Poland, April 12-14, 2015. Book of abstracts. [B.m.] : [b.w.], 2015, s. 81

41/97
Nr opisu: 0000099361
Least squares estimators of peptide species concentrations based on Gaussian mixture decompositions of protein mass spectra.
[Aut.]: Andrzej Polański, Michał Marczyk, M. Pietrowska, P. Widłak, Joanna Polańska.
W: Stochastic models, statistics and their applications, Wrocław, Poland, February 2015. Eds. Ansgar Steland, Ewaryst Rafajłowicz, Krzysztof Szajowski. Berlin : Springer International Publishing, 2015, s. 425-432, bibliogr. 21 poz. (Springer Proceedings in Mathematics & Statistics ; vol. 122 2194-1009)

42/97
Nr opisu: 0000101383
MicroRNA (MiRNA) expression profiles in early colon cancer (CC) and lung adenocarcinoma (AC).
[Aut.]: M. Skrzypski, Michał Marczyk, M. Bobowicz, P. Czapiewski, A. Maciejewska, R. Pawłowski, Joanna Polańska, J. Jassem.
-J. Clin. Cardiol. 2015 vol. 33 iss. 15, suppl. S, e22062
Streszczenie referatu wygłoszonego na: Annual Meeting of the American Society of Clinical Oncology (ASCO), May 29 - June 02, 2015, Chicago

43/97
Nr opisu: 0000099360
Mixture model based efficient method for magnetic resonance spectra quantification.
[Aut.]: Franciszek Eugeniusz* Binczyk, Michał Marczyk, Joanna Polańska.
W: Bioinformatics and biomedical engineering. Third International Conference, IWBBIO 2015, Granada, Spain, April 15-17, 2015. Proceedings. Pt. 2. Eds.: Francisco Ortuno, Ignacio Rojas. Cham : Springer, 2015, s. 406-417, bibliogr. 14 poz. (Lecture Notes in Computer Science ; vol. 9044 Lecture Notes in Artificial Intelligence ; 0302-9743)

model mieszaniny gaussowskiej ; przetwarzanie spektrów ; obrazowanie magnetyczno-rezonansowe ; GPU

gaussian mixture model ; spectra pre-processing ; magnetic resonance imaging ; GPU

44/97
Nr opisu: 0000110169
Modeling of imaging mass spectrometry data and testing by permutation for biomarkers discovery in tissues.
[Aut.]: Michał Marczyk, Grzegorz Drążek, M. Pietrowska, P. Widlak, Joanna Polańska, Andrzej Polański.
W: International Conference on Computational Science. ICCS 2015. Computational Science at the Gates of Nature, June 1-3, 2015, Reykjavík, Iceland. Ed. by Slawomir Koziel, Leifur Leifsson, Michael Lees, Valeria V. Krzhizhanovskaya, Jack Dongarra and Peter M.A. Sloot. Amsterdam : Elsevier, 2015, s. 693-702, bibliogr. 18 poz. (Procedia Computer Science ; vol. 51 1877-0509)

cancer ; gaussian mixture model ; mass spectrometry imaging

45/97
Nr opisu: 0000104018
Modeling of protein spots on 2D gel electrophoresis images.
[Aut.]: Michał Marczyk.
W: XIXth Gliwice Scientific Meetings 2015, Gliwice, November 20-21, 2015 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2015, (plik pdf) s. 110
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2015.pdf [dostęp 25 stycznia 2016]

46/97
Nr opisu: 0000103930
Novel algorithm for highly efficient Gaussian mixture modeling in mass spectrometry.
[Aut.]: Andrzej Polański, Michał Marczyk, M. Pietrowska, P. Widlak, Joanna Polańska.
W: 9th Central and Eastern European Proteomics Conference. CEEPC 2015, Poznań, 15-18.06.2015. [B.m.] : [b.w.], 2015, s. 11

47/97
Nr opisu: 0000111610
Searching for radiosensitivity biomarkers by Monte Carlo feature selection and rough sets approach.
[Aut.]: Joanna Żyła, Michał Marczyk, Joanna Polańska.
W: VII Konwersatorium Chemii Medycznej oraz VIII Sympozjum PTBI, Lublin, 17-19.09.2015. Polskie Towarzystwo Chemii Medycznej, Polskie Towarzystwo Bioinformatyczne, Uniwersytet Medyczny w Lublinie. Lublin : Perfekta info, 2015, s. 75, bibliogr. 3 poz.

48/97
Nr opisu: 0000101186
Signal partitioning algorithm for highly efficient gaussian mixture modeling in mass spectrometry.
[Aut.]: Andrzej Polański, Michał Marczyk, M. Pietrowska, P. Widlak, Joanna Polańska.
-PLoS One 2015 vol. 10 iss. 7, e0134256, s. 1-19, bibliogr. 39 poz.. Impact Factor 3.234. Punktacja MNiSW 40.000

49/97
Nr opisu: 0000090874
An efficient algorithm for microarray probes re-annotation.
[Aut.]: Paweł Foszner, Aleksandra Helena Gruca, Andrzej Polański, Michał Marczyk, Roman Jaksik, Joanna Polańska.
W: Transactions on computational collective intelligence XIII. Eds: Ngoc-Thanh Nguyen, Hoai An Le Thi. Berlin : Springer, 2014, s. 201-218, bibliogr. 10 poz. (Lecture Notes in Computer Science ; vol. 8342 0302-9743)

re-adnotacja ; mikromacierz ; wyrażenie danych ; Affymetrix ; klasyfikacja

re-annotation ; microarray ; expression data ; Affymetrix ; classification

50/97
Nr opisu: 0000097393
An efficient approach for estimating GMM initial conditions as a way of improvement of Nuclear Magnetic resonance spectra analysis.
[Aut.]: Franciszek Eugeniusz* Binczyk, Michał Marczyk, Andrzej Polański, Joanna Polańska.
W: Abstracts of the BIO 2014 Congress, Warsaw, Poland, September 9th - 12th 2014. Warszawa : [b.w.], 2014, s. 83 (Acta Biochimica Polonica ; vol. 61, suppl. 1 0001-527X)

51/97
Nr opisu: 0000096617
Automatic detection of outlying microarrays using multi-array quality metrics.
[Aut.]: Michał Marczyk, Łukasz* Król, Joanna Polańska.
W: IWBBIO 2014. International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, Granada, April, 7-9 2014. Proceedings. Vol. 1. Eds. Francisco Ortuno, Ignacio Rojas. [B.m.] : [b.w.], 2014, s. 738-746, bibliogr. 14 poz.

mikromacierz ; NUSE ; QC ; RLE ; chip genowy

microarray ; NUSE ; QC ; RLE ; gene chip

52/97
Nr opisu: 0000088351
Comparison of algorithms for profile-based alignment of low resolution MALDI-ToF spectra.
[Aut.]: Michał Marczyk, Joanna Polańska, Andrzej Polański.
W: Man-machine interactions 3. Eds: Aleksandra Gruca, Tadeusz Czachórski, Stanislaw Kozielski. Berlin : Springer, 2014, s. 193-201, bibliogr. 14 poz. (Advances in Intelligent Systems and Computing ; vol. 242 2194-5357)

dostosowanie widma ; MALDI-ToF

spectra alignment ; MALDI-ToF ; MS pre-processing

53/97
Nr opisu: 0000111602
Components of serum peptidome can differentiate between healthy controls and patients with early stage lung cancer.
[Aut.]: P. Widlak, M. Pietrowska, Joanna Polańska, Michał Marczyk, R. Dziadziuszko, W. Rzyman.
W: Winning combinations for precision cancer medicine. WIN 2014 Symposium, Paris, France, 23-24 June 2014. [B.m.] : [b.w.], 2014, s. 1

54/97
Nr opisu: 0000096317
Fast and efficient technique of magnetic resonance spectra decomposition based on mixture model.
[Aut.]: Franciszek Eugeniusz* Binczyk, Michał Marczyk, Joanna Polańska.
W: XVIIIth Gliwice Scientific Meetings, November 21-22, 2014 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2014, s.55
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2014.pdf [dostęp 14 kwietnia 2020]

55/97
Nr opisu: 0000097400
Methods for quality control of low-resolution MALDI-ToF spectra.
[Aut.]: Michał Marczyk, Joanna Polańska.
W: Proceedings of the International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms. Bioinformatics 2014, ESEO, Angers, Loire Valley, France, 3-6 March, 2014. Eds. Oscar Pastor, Christine Sinoquet, Guy Plantier, Tanja Schultz, Ana Fred, Hugo Gamboa. [B.m.] : SCITEPRESS, 2014, s. 172-177, bibliogr. 14 poz.

MALDI-ToF ; profilowanie białek ; kontrola jakości

MALDI-ToF ; protein profiling ; quality control

56/97
Nr opisu: 0000097392
Modeling of MALDI-ToF spectra by parallel computing.
[Aut.]: Michał Marczyk, Joanna Polańska, Andrzej Polański.
W: Abstracts of the BIO 2014 Congress, Warsaw, Poland, September 9th - 12th 2014. Warszawa : [b.w.], 2014, s. 97 (Acta Biochimica Polonica ; vol. 61, suppl. 1 0001-527X)

57/97
Nr opisu: 0000097790
Radiation induced changes in levels of selected proteins in peripheral blood serum of breast cancer patients as a potential triage biodosimeter for large-scale radiological emergencies.
[Aut.]: M. Deperas-Kaminska, A. Bajinskis, Michał Marczyk, Joanna Polańska, P. Wersall, E. Lindbrink, E. A. Ainsbury, O. Guipaud, M. Benderitter, S. Haghdoost, A. Wojcik.
W: 41st Annual Meeting of the European Radiation Research Society. ERR2014, Rhodes, Greece, September 14-19, 2014. Abstract book. [B.m.] : [b.w.], 2014, s. 48

58/97
Nr opisu: 0000095741
Radiation-induced changes in levels of selected proteins in peripheral blood serum of breast cancer patients as a potential triage biodosimeter for large-scale radiological emergencies.
[Aut.]: M. Deperas-Kaminska, A. Bajinskis, Michał Marczyk, Joanna Polańska, P. Wersall, E. Lidbrink, E. A. Ainsbury, O. Guipaud, M. Benderitter, S. Haghdoost, A. Wójcik.
-Health Phys. 2014 vol. 107 iss. 6, s. 555-563, bibliogr. 36 poz.. Impact Factor 1.271. Punktacja MNiSW 25.000

59/97
Nr opisu: 0000096470
Radiation-induced changes in serum lipidome of head and neck cancer patients.
[Aut.]: K. Jelonek, M. Pietrowska, A. Zagdanski, A. Suchwalko, Joanna Polańska, Michał Marczyk, T. Rutkowski, K. Skladowski, M. R. Clench, P. Widlak.
-Int. J. Mol. Sci. 2014 vol. 15 iss. 4, s. 6609-6624, bibliogr. 39 poz.. Impact Factor 2.862. Punktacja MNiSW 30.000

zależność dawka-objętość ; intensywnie modulowana radioterapia ; spektrometria masowa ; toksyczność promieniowania

dose-volume effect ; intensity-modulated radiation therapy ; mass spectrometry ; radiation toxicity ; serum lipidome

60/97
Nr opisu: 0000097402
Radiotherapy-related changes in serum lipidome of head and neck cancer patients.
[Aut.]: K. Jelonek, M. Pietrowska, M. Ros, A. Zagdanski, A. Suchwalko, Joanna Polańska, Michał Marczyk, T. Rutkowski, K. Skladowski, M. R. Clench, P. Widlak.
W: 4th Conference of Polish Mass Spectrometry Society, Trzebnica, 26-29 May 2014. Program and abstracts. Polish Mass Spectrometry Society, Faculty of Chemistry. Uniwersity of Wrocław. [B.m.] : [b.w.], 2014, s. 61

61/97
Nr opisu: 0000096749
Sources of high variance between probe signals in affymetrix short oligonucleotide microarrays.
[Aut.]: Roman Jaksik, Michał Marczyk, Joanna Polańska, Joanna* Rzeszowska-Wolny.
-Sensors 2014 vol. 14 iss. 1, s. 532-548, bibliogr. 27 poz.. Impact Factor 2.245. Punktacja MNiSW 30.000

mikromacierz ; zawartość GC ; CDF ; g-kwadrupleks ; oligo (dT)

microarray ; GC-content ; custom CDF ; g-quadruplex ; oligo(dT)

62/97
Nr opisu: 0000090418
A parallel implementation of MALDI-ToF spectra modeling on cuda-enabled graphics hardware.
[Aut.]: Michał Marczyk, Joanna Polańska, Andrzej Polański.
W: XVIIth Gliwice Scientific Meetings, November 15-16, 2013 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2013, (plik pdf) s. 175
Dostępny w Internecie: http://www.bioinformatics.aei.polsl.pl/gsn/GSN_2013.pdf [dostęp 10 kwietnia 2013]

63/97
Nr opisu: 0000090547
Adaptive filtering of microarray gene expression data based on Gaussian mixture decomposition.
[Aut.]: Michał Marczyk, Roman Jaksik, Andrzej Polański, Joanna Polańska.
-BMC Bioinformatics 2013 vol. 14 art. nr 101, s. 1-12, bibliogr. 24 poz.. Impact Factor 2.672. Punktacja MNiSW 35.000

64/97
Nr opisu: 0000090560
Peak detection by Gaussian mixture modeling of MALDI-ToF spectra for proteome profiling.
[Aut.]: Michał Marczyk, Joanna Polańska, Andrzej Polański.
W: 21st Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. ISMB, Berlin, July 21-23, 2013. Book of abstracts. , Poster no. M26

65/97
Nr opisu: 0000088045
Przetwarzanie i klasyfikacja danych uzyskiwanych z użyciem wysokoprzepustowych technik pomiarowych biologii molekularnej. Rozprawa doktorska.
[Aut.]: Michał Marczyk.
Gliwice, 2013, 140 s., bibliogr. 257 poz.
Politechnika Śląska. Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki. Promotor: dr hab. inż. Joanna Polańska

mikromacierz ; MALDI-ToF ; GMM ; biologia molekularna ; spektrometria mas

microarray ; MALDI-ToF ; GMM ; molecular biology ; mass spectrometry

66/97
Nr opisu: 0000071268
Comparison of peptide cancer signatures identified by mass spectrometry in serum of patients with head and neck, lung and colorectal cancers. Association with tumor progression.
[Aut.]: M. Pietrowska, Joanna Polańska, R. Suwiński, M. Wideł, T. Rutkowski, Michał Marczyk, I. Dominczyk, L. Ponge, Ł. Marczak, Andrzej Polański, P. Widłak.
-Int. J. Oncol. 2012 vol. 40 iss. 1, s. 148-156. Impact Factor 2.657. Punktacja MNiSW 25.000

67/97
Nr opisu: 0000078431
Detection and quantification of MALDI ToF spectral peaks by using Gaussian mixture decomposition.
[Aut.]: Michał Marczyk, Andrzej Polański, Joanna Polańska.
W: XVIth Gliwice Scientific Meetings, November 16-17, 2012 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2012, (plik pdf) s. 28
Dostępny w Internecie: http://www.bioinformatics.aei.polsl.pl/gsn/GSN_2012.pdf [dostęp 21 lutego 2013]

68/97
Nr opisu: 0000078434
Mass profiling of cancer serum proteome - does it provide any useful information?.
[Aut.]: M. Pietrowska, I. Domińczyk, A. Gdowicz-Kłosok, A. Walaszczyk, M. Kalinowska-Herok, M. Roś, K. Jelonek, Joanna Polańska, Michał Marczyk, Andrzej Polański, P. Widłak.
W: XVIth Gliwice Scientific Meetings, November 16-17, 2012 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2012, (plik pdf) s. 29
Dostępny w Internecie: http://www.bioinformatics.aei.polsl.pl/gsn/GSN_2012.pdf [dostęp 21 lutego 2013]

69/97
Nr opisu: 0000071852
Application of MALDI ToF serum proteome pattern analysis in classification of patients with gastric cancer - a preliminary study.
[Aut.]: A. Gdowicz-Kłosok, K. Szołtysek, M. Pietrowska, J. Wydmański, Michał Marczyk, Joanna Polańska.
W: 29th Informal Meeting on Mass Spectrometry, Fierra di Primiero, Italy, 15-19.05, 2011. [B.m.] : [b.w.], 2011, s. 147

70/97
Nr opisu: 0000071212
Association between plasma proteome profiles analysed by mass spectrometry, a lymphocyte-based DNA-break repair assay and radiotherapy-induced acute mucosal reaction in head and neck cancer patients.
[Aut.]: M. Pietrowska, Joanna Polańska, A. Walaszczyk, A. Wygoda, T. Rutkowski, K. Składowski, Ł. Marczak, M. Stobiecki, Michał Marczyk, Andrzej Polański, P. Widlak.
-Int. J. Radiat. Biol. 2011 vol. 77 iss. 7, s. 711-719. Impact Factor 2.275

test kometowy ; spektrometria mas ; szyja ; głowa ; nowotwór ; proteomika

comet assay ; mass spectrometry ; neck ; head ; cancer ; proteomics

71/97
Nr opisu: 0000072259
Association between plasma proteome profiles analyzed by mass spectrometry, lymphocyte based DNA breaks repair assay and radiotherapy induced acute mucosal reaction in head and neck cancer patients.
[Aut.]: A. Walaszczyk, M. Pietrowska, Joanna Polańska, A. Wygoda, T. Rutkowski, K. Składowski, Ł. Marczak, M. Stobiecki, Michał Marczyk, Andrzej Polański, P. Widłak.
W: 29th Informal Meeting on Mass Spectrometry, Fierra di Primiero, Italy, 15-19.05, 2011. [B.m.] : [b.w.], 2011, s. 114-115

72/97
Nr opisu: 0000072197
Comparison of peptide cancer signatures identified by mass spectrometry in serum of patients with head & neck, colorectal and lung cancer.
[Aut.]: M. Pietrowska, Joanna Polańska, R. Suwiński, T. Rutkowski, Maria** Wideł, Ł. Marczak, Michał Marczyk, K. Wojtkiewicz, M. Roś, Andrzej Polański, P. Widłak.
W: 15th Gliwice Scientific Meetings, November 18-19, 2011 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2011, (plik pdf) s. 99
http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2011.pdf [dostęp 19 grudnia 2014]

73/97
Nr opisu: 0000071407
Comparison of peptide cancer signatures identified by mass spectrometry in serum of patients with head and neck, lung and colorectal cancers.
[Aut.]: M. Pietrowska, Joanna Polańska, R. Suwiński, T. Rutkowski, Maria** Wideł, Ł. Marczak, Michał Marczyk, K. Wojtkiewicz, M. Ros, M. Iwanow, Andrzej Polański, P. Widłak.
W: Abstracts of the 2nd Congress of Biochemistry and Cell Biology, 46th Meeting of the Polish Biochemical Society and 11st Conference of the Polish Cell Biology Society, Kraków, Poland, September 5th - 9th, 2011. Warszawa : [b.w.], 2011, s. 115 (Acta Biochimica Polonica ; vol. 58, suppl. 2 0001-527X)

74/97
Nr opisu: 0000071928
Discriminative gene selection in low dose radiotherapy microarray data for radiosensitivity profile search.
[Aut.]: Michał Marczyk, Roman Jaksik, Joanna Polańska, Andrzej Polański.
W: Book of Abstracts of the 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology, Kraków, June 28 - July 2, 2011. [B.m.] : [b.w.], 2011, s. 632-633

75/97
Nr opisu: 0000071577
Efficient algorithm for microarray probes re-annotation.
[Aut.]: Paweł Foszner, Aleksandra Helena Gruca, Andrzej Polański, Michał Marczyk, Roman Jaksik, Joanna Polańska.
W: Computational collective intelligence. Technologies and applications. ICCCI 2011. Third international conference, Gdynia, Poland, September 21-23, 2011. Proceedings. Pt 2. Eds: P. Jędrzejewicz, N.T. Nguyen, K. Hoang. Berlin : Springer, 2011, s. 281-289, bibliogr. 10 poz. (Lecture Notes in Computer Science ; vol. 6923 Lecture Notes in Artificial Intelligence ; 0302-9743)

readnotacja ; mikromacierz ; Affymetrix ; klasyfikacja ; poziom ekspresji genów

re-annotation ; microarray ; Affymetrix ; classification ; gene expression data

76/97
Nr opisu: 0000070642
Evaluation of available protein mass spectra pre-processing algorithms.
[Aut.]: Michał Marczyk.
-Bio-Algorithms and Med-Sys. 2011 vol. 7 no. 2, s. 25-30, bibliogr. 18 poz.. Punktacja MNiSW 5.000

biomarker ; białka ; struktura białka ; nowotwór ; przetwarzanie spektrów ; MALDI-ToF

biomarker ; proteins ; protein structure ; cancer ; spectra pre-processing ; MALDI-ToF

77/97
Nr opisu: 0000071400
Increasing power of MALDI-ToF spectra analysis by post-processing Gaussian spectral components.
[Aut.]: Michał Marczyk, Joanna Polańska.
W: Abstracts of the 2nd Congress of Biochemistry and Cell Biology, 46th Meeting of the Polish Biochemical Society and 11st Conference of the Polish Cell Biology Society, Kraków, Poland, September 5th - 9th, 2011. Warszawa : [b.w.], 2011, s. 207 (Acta Biochimica Polonica ; vol. 58, suppl. 2 0001-527X). Impact Factor 1.234

78/97
Nr opisu: 0000071874
MicroImage as a tool for microarray image artifacts correction.
[Aut.]: Roman Jaksik, Michał Marczyk, Joanna Polańska.
W: Abstracts of posters presented at the 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology, Kraków, June 28 - July 2, 2011. [B.m.] : [b.w.], 2011, s. 450-451

79/97
Nr opisu: 0000071882
Radiation-related changes in serum proteome profiles detected by mass spectrometry in blood of patients treated with radiotherapy due to larynx cancer?.
[Aut.]: M. Kalinowska-Herok, M. Pietrowska, K. Wojtkiewicz, T. Rutkowski, A. Wygoda, A. Walaszczyk, Ł. Marczak, Michał Marczyk, Joanna Polańska, K. Składowski, P. Widłak.
W: 14th International Congress of Radiation Research. ICRR 2011, Warszawa, Poland, 28 August - 1 September 2011. [B.m.] : [b.w.], 2011, s. 239-240

80/97
Nr opisu: 0000072198
Radiation-related changes in serum proteome profiles detected by mass spectrometry in blood of patients treated with radiotherapy due to larynx cancer.
[Aut.]: M. Pietrowska, K. Wojtkiewicz, T. Rutkowski, A. Wygoda, Ł. Marczak, A. Walaszczyk, I. Dominczyk, K. Składowski, M. Stobiecki, Michał Marczyk, Joanna Polańska, Andrzej Polański, P. Widłak.
W: 29th Informal Meeting on Mass Spectrometry, Fierra di Primiero, Italy, 15-19.05, 2011. [B.m.] : [b.w.], 2011, s. 55

81/97
Nr opisu: 0000071425
Radiation-related changes in serum proteome profiles detected by mass spectrometry in blood of patients treated with radiotherapy due to larynx cancer.
[Aut.]: P. Widłak, M. Pietrowska, K. Wojtkiewicz, T. Rutkowski, A. Wygoda, Ł. Marczak, Michał Marczyk, Joanna Polańska, A. Walaszczyk, I. Domińczyk, K. Składowski, M. Stobiecki, Andrzej Polański.
-J. Radiat. Res. 2011 vol. 52 no. 5, s. 575-581, bibliogr. 32 poz.. Impact Factor 1.683

biodozymetria ; rak głowy ; rak szyi ; promieniowanie jonizujące ; spektrometria mas ; proteomika ; radioterapia

biodosimetry ; head cancer ; neck cancer ; ionizing radiation ; mass spectrometry ; proteomics ; radiotherapy

82/97
Nr opisu: 0000072593
Radiation-related changes in serum proteome profiles detected by mass spectrometry in blood of patients treated with radiotherapy due to larynx cancer.
[Aut.]: P. Widlak, M. Pietrowska, T. Rutkowski, A. Wygoda, K. Składowski, K. Wojtkiewicz, Michał Marczyk, Joanna Polańska.
-Int. J. Radiat. Oncol. Biol. Phys. 2011 vol. 81 iss. 2, Suppl., s. S161-S162
Referat wygłoszony na: 53rd Annual Meeting of the American Society for Radiation Oncology, Miami Beach, Florida, October 2 - 6, 2011. Impact Factor 4.105

83/97
Nr opisu: 0000070202
A system for low level preprocessing of DNA microarray dat.
[Aut.]: Joanna Polańska, Michał Marczyk, Roman Jaksik.
W: 8th PTBi Workshop on Bioinformatics, Ustroń, October 1-3, 2010. [B.m.] : [b.w.], 2010, s. 9

84/97
Nr opisu: 0000068425
Analysis of plasma proteome profiles using mass spectrometry in head and neck cancer patients to search for correlations with lymphocyte-based DNA-breaks repair assay and radiotherapy induced acute mucosal reaction.
[Aut.]: M. Pietrowska, Joanna Polańska, A. Walaszczyk, A. Wygoda, T. Rutkowski, K. Składowski, Ł. Marczak, M. Stobiecki, Michał Marczyk, Andrzej Polański, P. Widłak.
W: Abstracts of the 45th Meeting of the Polish Biochemical Society, Wisła, Poland, September 20th - 23rd, 2010. Warszawa : [b.w.], 2010, s. 38 (Acta Biochimica Polonica ; vol. 57, suppl. 4 0001-527X). Impact Factor 1.234

spektrometria mas ; rak głowy ; rak szyi ; radioterapia

mass spectrometry ; head cancer ; neck cancer ; radiotherapy

85/97
Nr opisu: 0000068429
Application of mass spectrometry for detection of therapy-related changes in serum proteome of breast cancer patients.
[Aut.]: K. Wojtkiewicz, Michał Marczyk, Joanna Polańska, Andrzej Polański, Ł. Marczak, M. Stobiecki, M. Pietrowska, I. Dominczyk, K. Behrendt, E. Nowicka, R. Tarnawski, P. Widłak.
W: Abstracts of the 45th Meeting of the Polish Biochemical Society, Wisła, Poland, September 20th - 23rd, 2010. Warszawa : [b.w.], 2010, s. 41 (Acta Biochimica Polonica ; vol. 57, suppl. 4 0001-527X). Impact Factor 1.234

spektrometria mas ; rak piersi ; radioterapia

mass spectrometry ; breast cancer ; radiotherapy

86/97
Nr opisu: 0000068442
Association between plasma proteome profiles analyzed by mass spectrometry, lymphocite-based DNA-breaks repair assay and radiotherapy induced acute mucosal reaction in head and neck cancer patients.
[Aut.]: P. Widłak, M. Pietrowska, A. Walaszczyk, A. Wygoda, T. Rutkowski, K. Składowski, Ł. Marczak, M. Stobiecki, Michał Marczyk, Joanna Polańska, Andrzej Polański.
-Radiother. Oncol. 2010 vol. 96 suppl. 1, s. XVIII-XIX. Impact Factor 4.337

radioterapia ; rak głowy ; rak szyi

radiotherapy ; head cancer ; neck cancer

87/97
Nr opisu: 0000069002
Detection of radiation-related changes in serum proteome of patients treated with radiotherapy because of head and neck cancer.
[Aut.]: M. Pietrowska, K. Wojtkiewicz, A. Wygoda, T. Rutkowski, K. Składowski, Ł. Marczak, M. Stobiecki, Michał Marczyk, Joanna Polańska, Andrzej Polański, P. Widłak.
W: XIVth Gliwice Scientific Meetings 2010, Gliwice, 26-27.11.2010 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2010, (plik pdf) s. 79
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2010.pdf [dostęp 19 grudnia 2014]

88/97
Nr opisu: 0000068424
Different approaches for a MALDIToF spectra pre-processing and their influence on classification results.
[Aut.]: Michał Marczyk, Joanna Polańska.
W: Abstracts of the 45th Meeting of the Polish Biochemical Society, Wisła, Poland, September 20th - 23rd, 2010. Warszawa : [b.w.], 2010, s. 31 (Acta Biochimica Polonica ; vol. 57, suppl. 4 0001-527X). Impact Factor 1.234

spektrometria mas ; MALDI-ToF ; nowotwór

mass spectrometry ; MALDI-ToF ; cancer

89/97
Nr opisu: 0000070199
Discovery of genetic markers In patients over-responsive to low dose radiotherapy.
[Aut.]: Michał Marczyk, Roman Jaksik, Joanna Polańska, Andrzej Polański.
W: 8th PTBi Workshop on Bioinformatics, Ustroń, October 1-3, 2010. [B.m.] : [b.w.], 2010, s. 15

90/97
Nr opisu: 0000068975
Gene selection problem in identification of patients over-responsive to low dose radiotherapy.
[Aut.]: Michał Marczyk, Roman Jaksik, Joanna Polańska, Andrzej Polański.
W: XIVth Gliwice Scientific Meetings 2010, Gliwice, 26-27.11.2010 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2010, (plik pdf) s. 72
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2010.pdf [dostęp 19 grudnia 2014]

91/97
Nr opisu: 0000062443
Ocena dostępnych algorytmów przetwarzania białkowych spektrów masowych.
[Aut.]: Michał Marczyk.
-Bio-Algorithms and Med-Sys. 2010 vol. 6 no. 12 suppl. 1, s. 121

przetwarzanie spektrów ; MALDI-ToF ; biomarkery

spectra pre-processing ; MALDI-ToF ; biomarkers

92/97
Nr opisu: 0000068827
Wykorzystanie spektrometrii mas do analizy proteomu surowicy chorych na raka piersi.
[Aut.]: K. Wojtkiewicz, Michał Marczyk, Joanna Polańska, Andrzej Polański, Ł. Marczak, M. Stobiecki, M. Pietrowska, I. Domińczyk, K. Behrendt, E. Nowicka, R. Tarnawski, P. Widłak.
-Onkolog. Info 2010 t. 7 nr 2, s. 40-47, bibliogr. 20 poz.

rak piersi ; proteomika kliniczna ; spektrometria mas

breast cancer ; clinical proteomics ; mass spectrometry

93/97
Nr opisu: 0000054875
Align - a software tool for mass spectra preprocessing.
[Aut.]: Michał Marczyk.
W: XI International PhD Workshop = XI Międzynarodowe Warsztaty Doktoranckie. OWD 2009, [Wisła, 17-20 October 2009]. Polish Society of Theoretical and Applied Electrotechnics [et al.]. [Gliwice] : Organizing Committe of the Symposium PPEE & Seminar BSE, 2009, s. 88-91, bibliogr. 23 poz. (Archiwum Konferencji PTETiS ; vol. 26)
Toż na CD-ROM

94/97
Nr opisu: 0000058338
Mass spectrometry-based serum proteome pattern analysis in classification of different type of cancer.
[Aut.]: M. Pietrowska, K. Behrendt, E. Nowicka, M. Wideł, T. Rutkowski, A. Walaszczyk, R. Tarnawski, K. Składowski, M. Kryj, R. Suwiński, Ł. Marczak, M. Stobiecki, Michał Marczyk, Joanna Polańska, Andrzej Polański, P. Widłak.
W: Abstracts of the 44th Meeting of the Polish Biochemical Society, Łódź, Poland, September 16th-19th, 2009. Warszawa : [b.w.], 2009, s. 44 (Acta Biochimica Polonica ; vol. 56, suppl. 3 0001-527X). Impact Factor 1.262

95/97
Nr opisu: 0000058337
On the importance of the spectral alignment procedures in the mass spectrometry data pre-processing.
[Aut.]: Michał Marczyk, Joanna Polańska.
W: Abstracts of the 44th Meeting of the Polish Biochemical Society, Łódź, Poland, September 16th-19th, 2009. Warszawa : [b.w.], 2009, s. 41 (Acta Biochimica Polonica ; vol. 56, suppl. 3 0001-527X). Impact Factor 1.262

96/97
Nr opisu: 0000058907
Searching for dynamics' patterns in time-course gene expression profiles.
[Aut.]: Joanna Polańska, Joanna* Rzeszowska, Michał Marczyk, M. McRobbie, P. O'Neill, P. Widłak, Andrzej Polański.
W: XIIIth Gliwice Scientific Meetings 2009, Gliwice, November 20-21, 2009 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2009, (plik pdf) s. 81
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2009.pdf [dostęp 22 grudnia 2014]

97/97
Nr opisu: 0000054400
Weighted Gaussian mixture model for classification of MALDI-TOF mass spectra.
[Aut.]: Andrzej Polański, Joanna Polańska, M. Pietrowska, Ł. Marczak, Michał Marczyk, M. Stobiecki, R. Tarnawski, K. Składowski, P. Widłak.
W: Proceedings of the Fifteenth National Conference on Application of Mathematics in Biology and Medicine, Szczyrk, 15-19 September 2009. Gliwice : Institute of Automatic Control Faculty of Automatic Control, Electronics and Computer Science Silesian University of Technology, 2009, s. 89-95, bibliogr. 29 poz.

MALDI-ToF ; widmo masowe ; proteomika

MALDI-ToF ; mass spectrum ; proteomics

stosując format: