Wynik wyszukiwania
Zapytanie:
JAKSIK ROMAN
Liczba odnalezionych rekordów:
102
Przejście do opcji zmiany formatu
|
Wyświetlenie wyników w wersji do druku
|
Pobranie pliku do edytora
|
Przesłanie wyników do modułu analizy
|
excel
|
Nowe wyszukiwanie
1/102
Nr opisu:
0000131326
BioTest - remote platform for hypothesis testing and analysis of biomedical data.
[Aut.]: Krzysztof
Psiuk-Maksymowicz
, Roman
Jaksik
, Aleksander
Płaczek
, Aleksandra Helena
Gruca
, Sebastian
Student
, Damian
Borys
, Dariusz
Mrozek
, Krzysztof
Fujarewicz
, Andrzej
Świerniak
.
W:
Current trends in biomedical engineering and bioimages analysis
. Proceedings of the 21st Polish Conference on Biocybernetics and Biomedical Engineering, Zielona Góra, Poland, 25-27 September 2019. Eds.: Józef Korbicz, Roman Maniewski, Krzysztof Patan, Marek Kowal. Cham : Springer, 2020
, s. 152-165, bibliogr. 22 poz. (
Advances in Intelligent Systems and Computing
; vol. 1033 2194-5357).
Punktacja MNiSW
20.000
bioinformatyka
;
analiza danych biomedycznych
;
integracja danych
bioinformatics
;
biomedical data analysis
;
data integration
2/102
Nr opisu:
0000136063
Cell cycle as a fault tolerant control system.
[Aut.]: Jarosław
Śmieja
, Andrzej
Świerniak
, Roman
Jaksik
.
W:
Advanced, contemporary control
. Proceedings of KKA 2020 - the 20th Polish Control Conference, Łódź, Poland, 2020. Eds. Andrzej Bartoszewicz, Jacek Kabziński, Janusz Kacprzyk. Cham : Springer Nature Switzerland, 2020
, s. 555-566, bibliogr. 33 poz. (
Advances in Intelligent Systems and Computing
; vol. 1196 2194-5357).
Punktacja MNiSW
20.000
naprawa uszkodzeń DNA
;
sterowanie odporne na błędy
;
cykl komórkowy
;
mutacja
;
nowotwór
DNA damage repair
;
fault-tolerant control
;
cell cycle
;
mutation
;
cancer
3/102
Nr opisu:
0000137481
Circuits regulating superoxide and nitric oxide production and neutralization in different cell types: expression of participating genes and changes induced by ionizing radiation.
[Aut.]: Patryk
Bil
, Sylwia
Ciesielska
, Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
-
Antioxidants
2020 vol. 9 iss. 8
, s. 1-14, bibliogr. 56 poz..
Impact Factor
5.014.
Punktacja MNiSW
100.000
rodnik ponadtlenkowy
;
tlenek azotu
;
syntaza tlenku azotu
;
promieniowanie jonizujące
superoxide radical
;
nitric oxide
;
nitric oxigen synthase
;
ionizing radiation
4/102
Nr opisu:
0000138236
Discrimination between human populations using a small number of differentially methylated CpG sites: a preliminary study using lymphoblastoid cell lines and peripheral blood samples of European and Chinese origin.
[Aut.]: P.
Daca-Roszak
, Roman
Jaksik
, J.
Paczkowska
, M.
Witt
, E.
Ziętkiewicz
.
-
BMC Genomics
2020 vol. 21 iss. 1
, s. 1-15, bibliogr. 61 poz..
Impact Factor
3.594.
Punktacja MNiSW
140.000
metylacja DNA
;
identyfikacja populacji ludzkiej
;
pirosekwencjonowanie
DNA methylation
;
human population identification
;
pyrosequencing
;
population differentiating CpGs
5/102
Nr opisu:
0000135436
Heuristic search of exact biclusters in binary data.
[Aut.]: Marcin
Michalak
, Roman
Jaksik
, D.
Ślęzak
.
-
Int. J. Appl. Math. Comput. Sci.
2020 vol. 30 nr 1
, s. 161-171, bibliogr. 19 poz..
Impact Factor
0.967.
Punktacja MNiSW
100.000
biklasteryzacja
;
wnioskowanie boolowskie
;
implikanty proste
;
analiza danych biomedycznych
;
heurystyka Johnsona
biclustering
;
Boolean reasoning
;
prime implicants
;
biomedical data analysis
;
Johnson heuristic
6/102
Nr opisu:
0000135879
hsa-miR-20b-5p and hsa-miR-363-3p affect expression of PTEN and BIM tumor suppressor genes and modulate survival of T-ALL cells in vitro.
[Aut.]: M.
Drobna
, B.
Szarzyńska-Zawadzka
, Roman
Jaksik
, Ł.
Sędek
, A.
Kuchmiy
, T.
Taghon
, P.
Van Vlierberghe
, T.
Szczepański
, M.
Witt
, M.
Dawidowska
.
-
Cells
2020 vol. 9 iss. 5
, s. 1-19, bibliogr. 60 poz..
Impact Factor
4.366.
Punktacja MNiSW
140.000
rakotwórcze miRNAs
;
ostra białaczka limfoblastyczna
;
wyciszanie genów supresorowych nowotworów
;
klaster miRNA
;
niekodujące RNA
;
rak
oncogenic miRNAs
;
acute lymphoblastic leukemia
;
silencing tumor suppressor genes
;
miRNA cluster
;
noncoding RNAs
;
cancer
7/102
Nr opisu:
0000138276
Statistical inference for the evolutionary history of cancer genomes.
[Aut.]: K. N.
Dinh
, Roman
Jaksik
, Marek
Kimmel
, A.
Lambert
, S.
Tavare
.
-
Stat. Sci.
2020 vol. 35 nr 1
, s. 129-144, bibliogr..
Impact Factor
3.583.
Punktacja MNiSW
200.000
rozwój nowotworu
;
koalescencja
;
proces narodziny-śmierć
;
widmo częstotliwości lokalizacji
;
heterogeniczność guza
;
selekcja klonalna
;
ploidalność
;
sekwencjonowanie masowe
cancer evolution
;
coalescent
;
birth-death process
;
site frequency spectrum
;
tumor heterogeneity
;
clonal selection
;
ploidy
;
bulk sequencing
8/102
Nr opisu:
0000128509
A mathematical model as a tool to identify microRNAs with highest impact on transcriptome changes.
[Aut.]: Marzena*
Mura
, Roman
Jaksik
, Anna
Lalik
, K.
Biernacki
, Marek
Kimmel
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
, Krzysztof
Fujarewicz
.
-
BMC Genomics
2019 vol. 20
, art. no. 114 s. 1-16, bibliogr. 78 poz..
Impact Factor
3.594.
Punktacja MNiSW
140.000
miRNA
;
interakcje miRNA-mRNA
;
promieniowanie jonizujące
;
czynnik stresogenny
miRNA
;
miRNA-mRNA interactions
;
ionizing radiation
;
stressing factor
9/102
Nr opisu:
0000128911
A novel role for Bst2 and E-selectin in IFNg-stimulated HSC niche relocalization.
[Aut.]: K.
Matatall
, H.
Wang
, Roman
Jaksik
, M.
Kimmel
, D.
Park
, K. Y.
King
.
-
Blood
2019 vol. 132 suppl. 1
, s. 874
10/102
Nr opisu:
0000135042
Analysis of factors affecting the precision of gene expression measurement methods.
[Aut.]: Anna
Lalik
, Krzysztof
Puszyński
, Roman
Jaksik
.
W:
2019 13th International Conference on Signal Processing and Communication Systems (ICSPCS), Gold Coast, Australia, December 16-18, 2019
. Proceedings. Eds.: Tadeusz A. Wysocki & Beata J. Wysocki. Piscataway : Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2019
, s. 1-5, bibliogr. 19 poz..
Punktacja MNiSW
20.000
ekspresja genów
;
RT-QPCR
;
mikromacierz oligonukleotydowa
;
sekwencjonowanie RNA
gene expression
;
RT-QPCR
;
oligonucleotide microarray
;
RNA sequencing
11/102
Nr opisu:
0000128961
Comprehensive investigation of miRNome identifies novel candidate miRNA-mRNA interactions implicated in T-cell acute lymphoblastic leukemia.
[Aut.]: M.
Dawidowska
, Roman
Jaksik
, M.
Drobna
, B.
Szarzyńska-Zawadzka
, M.
Kosmalska
, Ł.
Sędek
, L.
Machowska
, Anna
Lalik
, M.
Lejman
, M.
Ussowicz
, K.
Kałwak
, J. R.
Kowalczyk
, Ł.
Szczepański
, M.
Witt
.
-
Neoplasia
2019 vol. 21 iss. 3
, s. 294-310, bibliogr. 109 poz..
Impact Factor
5.696.
Punktacja MNiSW
140.000
12/102
Nr opisu:
0000135043
Correction of the genes expression measurements based on the probes design features.
[Aut.]: Krzysztof
Puszyński
, Anna
Lalik
, Roman
Jaksik
.
W:
2019 13th International Conference on Signal Processing and Communication Systems (ICSPCS), Gold Coast, Australia, December 16-18, 2019
. Proceedings. Eds.: Tadeusz A. Wysocki & Beata J. Wysocki. Piscataway : Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2019
, s. 1-6, bibliogr. 11 poz..
Punktacja MNiSW
20.000
mikromacierz
;
przetwarzanie sygnałów
;
bioinformatyka
;
pary GC
microarray
;
signal processing
;
bioinformatics
;
GC pairs
13/102
Nr opisu:
0000135021
Nucleotide composition bias in high throughput gene expression measurement methods.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Anna
Lalik
, Krzysztof
Puszyński
.
W:
2019 13th International Conference on Signal Processing and Communication Systems (ICSPCS), Gold Coast, Australia, December 16-18, 2019
. Proceedings. Eds.: Tadeusz A. Wysocki & Beata J. Wysocki. Piscataway : Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2019
, s. 1-6, bibliogr. 35 poz..
Punktacja MNiSW
20.000
sekwencjonowanie RNA
;
mikromacierz oligonukleotydowa
;
bioinformatyka
;
wykrywanie genów o zróżnicowanej ekspresji
RNA sequencing
;
oligonucleotide microarray
;
bioinformatics
;
detection of differentially expressed genes
14/102
Nr opisu:
0000128340
PTEN abnormalities predict poor outcome in children with T-cell acute lymphoblastic leukemia treated according to ALL IC-BFM protocols.
[Aut.]: B.
Szarzyńska-Zawadzka
, J. B.
Kunz
, Ł.
Sędek
, M.
Kosmalska
, K.
Zdon
, P.
Biecek
, O.
Bandapalli
, M.
Kraszewska-Hamilton
, Roman
Jaksik
, M.
Drobna
, J. R.
Kowalczyk
, T.
Szczepański
, P.
Van Vlierberghe
, A. E.
Kulozik
, M.
Witt
, M.
Dawidowska
.
-
Am. J. Hematol.
2019 vol. 94 iss. 4
, s. E93-E96, bibliogr. 6 poz..
Impact Factor
6.973.
Punktacja MNiSW
140.000
15/102
Nr opisu:
0000132789
Study of DNA replication origins based on somatic mutation patterns and dynamic programming.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, D.
Wheeler
, Marek
Kimmel
.
W:
XII Symposium of Polish Bioinformatics Society, Kraków, September 19-21, 2019
. Book of abstracts. [B. m.] : [b.w.], 2019
, s. 48
16/102
Nr opisu:
0000121552
Detection of genetic aberrations in cancer driving signaling pathways based on joint analysis of heterogeneous genomics data.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Krzysztof
Fujarewicz
.
W:
Proceedings of the International Conference on Information Technology & Systems
. ICITS 18, Libertad City, Ecuador, January 10 - 12, 2018. Eds.: Alvaro Rocha, Teresa Guarda. Cham : Springer, 2018
, s. 484-494, bibliogr. 13 poz. (
Advances in Intelligent Systems and Computing
; vol. 721 2194-5357).
Punktacja MNiSW
15.000
ścieżka sygnalizacyjna
;
sekwencjonowanie
;
metylacja
;
ekspresja genów
;
zmiana liczby kopii
;
wzajemna wyłączność
signaling pathway
;
sequencing
;
methylation
;
gene expression
;
copy-number alteration
;
mutual exclusivity
17/102
Nr opisu:
0000118937
Functional interpretation of gene sets: semantic-based clustering of gene ontology terms on the BioTest platform.
[Aut.]: Aleksandra Helena
Gruca
, Roman
Jaksik
, Krzysztof
Psiuk-Maksymowicz
.
W:
Man-machine interactions 5
. 5th International Conference on Man-Machine Interactions, ICMMI 2017, Kraków, Poland, October 3-6, 2017. Eds. Aleksandra Gruca, Tadeusz Czachórski, Katarzyna Harezlak, Stanisław Kozielski, Agnieszka Piotrowska. Berlin : Springer International Publishing, 2018
, s. 125-136, bibliogr. 33 poz. (
Advances in Intelligent Systems and Computing
; vol. 659 2194-5357).
Punktacja MNiSW
15.000
ontologia genowa
;
grupowanie
;
podobieństwo semantyczne
;
platforma BioTest
;
mikromacierz DNA
;
profilowanie molekularne
;
wykładnia funkcjonalna
gene ontology
;
clustering
;
semantic similarity
;
BioTest platform
;
DNA microarray
;
molecular profiling
;
functional interpretation
18/102
Nr opisu:
0000127035
GaMRed - adaptive filtering of high-throughput biological data.
[Aut.]: Michał
Marczyk
, Roman
Jaksik
, Andrzej
Polański
, Joanna
Polańska
.
-
IEEE/ACM Trans. Comput. Biol. Bioinformat.
2018 in press
, s. 1-10, bibliogr. 20 poz..
Impact Factor
2.896.
Punktacja MNiSW
30.000
filtrowanie informacji
;
rozkład mieszaniny Gaussa
;
wysokoprzepustowe dane biologiczne
information filtering
;
Gaussian mixture decomposition
;
high throughput biological data
19/102
Nr opisu:
0000126067
Identification of endogenous control miRNAs for RT-qPCR in T-cell acute lymphoblastic leukemia.
[Aut.]: M.
Drobna
, B.
Szarzyńska-Zawadzka
, P.
Daca-Roszak
, M.
Kosmalska
, Roman
Jaksik
, M.
Witt
, M.
Dawidowska
.
-
Int. J. Mol. Sci.
2018 vol. 19 iss. 10
, art. no. 2858 s. 1-17, bibliogr. 65 poz..
Impact Factor
4.183.
Punktacja MNiSW
30.000
miRNA
;
mikroRNA
;
kontrola endogenna
;
geny referencyjne
;
analiza tkanki
;
linia komórkowa
;
ostra białaczka limfoblastyczna T-komórkowa
;
T-ALL
;
normalizacja ekspresji miRNA w RT-qPCR
miRNA
;
microRNA
;
endogenous control
;
reference genes
;
tissue analysis
;
cell lines
;
T-cell acute lymphoblastic leukemia
;
T-ALL
;
normalization of miRNA expression in RT-qPCR
20/102
Nr opisu:
0000125348
Identification of factors that affect reproducibility of mutation calling methods in data originating from the next-generation sequencing.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Krzysztof
Psiuk-Maksymowicz
, Andrzej
Świerniak
.
W:
Computer and information sciences
. 32nd International symposium, ISCIS 2018 held at the 24th IFIP World Computer Congress, WCC 2018, Poznan, Poland, September 20-21, 2018. Proceedings. Eds. Tadeusz Czachórski, Erol Gelenbe, Krzysztof Grochla, Ricardo Lent. Cham : Springer, 2018
, s. 264-271, bibliogr. 18 poz. (
Communications in Computer and Information Science
; vol. 935 1865-0929).
Punktacja MNiSW
20.000
analiza danych bioinformatycznych
;
sekwencjonowanie nowej generacji
;
mutacja somatyczna
;
powtarzalność wyników
;
sekwencjonowanie całoeksomowe
bioinformatic data analysis
;
next generation sequencing
;
somatic mutation
;
reproducibility of results
;
whole exome sequencing
21/102
Nr opisu:
0000127243
MIR-20B-5P and MIR-363-3P as candidate oncomirs in pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia.
[Aut.]: M.
Drobna
, B.
Szarzyńska-Zawadzka
, M.
Kosmalska
, Roman
Jaksik
, M.
Witt
, M.
Dawidowska
.
W:
XXIInd Gliwice Scientific Meetings 2018, Gliwice, November 16-17, 2018
. [B.m.] : [b.w.], 2018
, s. 60
22/102
Nr opisu:
0000120685
Proteome profiles of different types of thyroid cancers.
[Aut.]: M.
Gawin
, A.
Wojakowska
, M.
Pietrowska
, Ł.
Marczak
, M.
Chekan
, K.
Jelonek
, D.
Lange
, Roman
Jaksik
, Aleksandra Helena
Gruca
, P.
Widłak
.
-
Mol. Cell. Endocrinol.
2018 vol. 472
, s. 68-79, bibliogr. 50 poz..
Impact Factor
3.693.
Punktacja MNiSW
35.000
biomarkery
;
tkanki FFPE
;
spektrometria mas
;
proteomika
;
rak tarczycy
biomarkers
;
FFPE tissue
;
mass spectrometry
;
proteomics
;
thyroid cancer
23/102
Nr opisu:
0000125424
The use of distributed data storage and processing systems in bioinformatic data analysis.
[Aut.]: M.
Bochenek
, K.
Folkert
, Roman
Jaksik
, M.
Krzesiak
, M.
Michalak
, Marek
Sikora
, T.
Stęclik
, Łukasz
Wróbel
.
W:
Beyond databases, architectures and structures
. Facing the challenges of data proliferation and growing variety. 14th International conference, BDAS 2018 held at the 24th IFIP World Computer Congress, WCC 2018, Poznan, Poland, September 18-20, 2018. Proceedings. Eds. Stanisław Kozielski, Dariusz Mrozek, Paweł Kasprowski, Bożena Małysiak-Mrozek, Daniel Kostrzewa. Cham : Springer, 2018
, s. 18-32, bibliogr. 25 poz. (
Communications in Computer and Information Science
; vol. 928 1865-0929).
Punktacja MNiSW
20.000
dane biomedyczne
;
obliczenia rozproszone
;
mutacja genu
;
analiza danych TCGA
;
ekosystem Hadoop
biomedical data
;
distributed computing
;
gene mutation
;
TCGA data analysis
;
Hadoop ecosystem
24/102
Nr opisu:
0000125307
Transcriptomic population markers for human population discrimination.
[Aut.]: P.
Daca-Roszak
, M.
Świerniak
, Roman
Jaksik
, T.
Tyszkiewicz
, M.
Oczko-Wojciechowska
, J.
Zebracka-Gala
, B.
Jarzab
, M.
Witt
, E.
Ziętkiewicz
.
-
BMC genetics
2018 vol. 19 no. 54
, s. 1-11, bibliogr. 28 poz..
Impact Factor
2.547.
Punktacja MNiSW
25.000
badanie ekspresji genów
;
platforma Illumina
;
karta TLDA
;
znacznik populacji mRNA
;
drzewo decyzyjne
;
test klasyfikatora
;
identyfikacja populacji ludzkiej
gene expression study
;
Illumina platform
;
TLDA card
;
population-specific mRNA marker
;
decision-tree
;
classifier testing
;
human population identification
25/102
Nr opisu:
0000121949
Changes in gene expression in HCT116 and ME45 cell lines.
[Aut.]: Sylwia
Kała
, Dorota*
Hudy
, Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
XXIst Gliwice Scientific Meetings 2017, Gliwice, November 17-18, 2017
. [B.m.] : [b.w.], 2017
, s. 101
26/102
Nr opisu:
0000121898
Detection of DNA replication origins based on somatic mutations.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Marek
Kimmel
.
W:
XXIst Gliwice Scientific Meetings 2017, Gliwice, November 17-18, 2017
. [B.m.] : [b.w.], 2017
, s. 93
27/102
Nr opisu:
0000121962
HSF1-dependent regulation of lncRNA transcription in response to heat shock.
[Aut.]: Katarzyna
Mrowiec
, A.
Toma-Jonik
, J.
Korfanty
, Roman
Jaksik
, P.
Janus
, M.
Chadalski
, N.
Vydra
, W.
Widlak
.
W:
XXIst Gliwice Scientific Meetings 2017, Gliwice, November 17-18, 2017
. [B.m.] : [b.w.], 2017
, s. 123
28/102
Nr opisu:
0000116602
Is cell cycle a perfect fault tolerant control system?. System engineering point of view.
[Aut.]: Andrzej
Świerniak
, Roman
Jaksik
, Jarosław
Śmieja
.
W:
Proceedings of the 13th IASTED International Conference on Biomedical Engineering
. BioMed 2017, Innsbruck, Austria, 20 February 2017 through 21 February 2017. Eds.: Rita Kiss, Philipp J. Thurner. Anaheim : Acta Press, 2017
, s. 108-113, bibliogr. 28 poz..
Punktacja MNiSW
15.000
cykl komórkowy
;
naprawa uszkodzeń DNA
;
system podatny na błędy
;
moduł regulatorowy p53
cell cycle
;
DNA damage repair
;
fault prone system
;
p53 regulatory module
29/102
Nr opisu:
0000115872
Scalability of a genomic data analysis in the BioTest platform.
[Aut.]: Krzysztof
Psiuk-Maksymowicz
, Dariusz
Mrozek
, Roman
Jaksik
, Damian
Borys
, Krzysztof
Fujarewicz
, Andrzej
Świerniak
.
W:
Intelligent information and database systems
. 9th Asian Conference, ACIIDS 2017, Kanazawa, Japan, April 3-5, 2017. Proceedings. Pt. 2. Eds. Ngoc Thanh Nguyen, Satoshi Tojo, Le Minh Nguyen, Bogdan Trawiński. Cham : Springer International Publishing, 2017
, s. 741-752, bibliogr. 21 poz. (
Lecture Notes in Computer Science
; vol. 10192
Lecture Notes in Artificial Intelligence
; 0302-9743).
Punktacja MNiSW
20.000
bioinformatyka
;
skalowalność
;
platforma obliczeniowa
;
klaster HPC
;
workload manager
;
analiza danych NGS
bioinformatics
;
scalability
;
computational platform
;
HPC cluster
;
workload manager
;
NGS data analysis
30/102
Nr opisu:
0000121880
T-cell acute lymphoblastic leukemia from miRNA transcriptome perspective.
[Aut.]: M.
Dawidowska
, B.
Szarzyńska-Zawadzka
, Roman
Jaksik
, M.
Drobna
, M.
Kosmalska
, Ł.
Sędek
, T.
Szczepański
, M.
Witt
.
W:
XXIst Gliwice Scientific Meetings 2017, Gliwice, November 17-18, 2017
. [B.m.] : [b.w.], 2017
, s. 41
31/102
Nr opisu:
0000106341
A holistic approach to testing biomedical hypotheses and analysis of biomedical data.
[Aut.]: Krzysztof
Psiuk-Maksymowicz
, A.
Płaczek
, Roman
Jaksik
, Sebastian
Student
, Damian
Borys
, Dariusz
Mrozek
, Krzysztof
Fujarewicz
, Andrzej
Świerniak
.
W:
Beyond databases, architectures and structures
. Advanced technologies for data mining and knowledge discovery. 12th International conference, BDAS 2016, Ustroń, Poland, May 31 - June 3, 2016. Proceedings. Eds. Stanisław Kozielski, Dariusz Mrozek, Paweł Kasprowski, Bożena Małysiak-Mrozek, Daniel Kostrzewa. [B.m.] : Springer, 2016
, s. 449-462, bibliogr. 24 poz. (
Communications in Computer and Information Science
; vol. 613 1865-0929)
baza danych NoSQL
;
hurtownia danych
;
Big Data
;
ETL
;
przetwarzanie danych biomedycznych
;
MapReduce
NoSQL database
;
data warehouse
;
Big Data
;
ETL
;
biomedical data processing
;
MapReduce
;
multiversion dynamic-schema
32/102
Nr opisu:
0000115334
Analysis of RNA interference mechanisms after ionizing radiation. Experiment and model.
[Aut.]: Marzena*
Dołbniak
, Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
, Krzysztof
Fujarewicz
.
W:
28th European Conference on Operational Research
. EURO 2016, Poznań, 3-6 07 2016. Conference handbook. EURO The European Association of Operational Research Society, Polish Operational and Systems Research Society, Poznan University of Technology.
, s. 130-131
33/102
Nr opisu:
0000106309
Cell-cycle gene expression analysis using real time PCR in locally advanced squamous-cell head and neck cancer.
[Aut.]: G.
Woźniak
, R.
Herok
, Roman
Jaksik
, M.
Misiołek
, B.
Kolebacz
, A.
Fiszer-Kierzkowska
, K.
Miśkiewicz-Orczyk
, C.
Szymczyk
, A.
Maciejewski
, G.
Głowacki
, R.
Suwiński
.
-
Adv. Med. Sci.
2016 vol. 61 iss. 2
, s. 293-299, bibliogr. 16 poz..
Impact Factor
1.364.
Punktacja MNiSW
15.000
geny cyklu komórkowego
;
rak głowy
;
rak szyi
;
PRC
cell cycle genes
;
head cancer
;
neck cancer
;
PCR
34/102
Nr opisu:
0000104515
Gene signature of the post-Chernobyl papillary thyroid cancer.
[Aut.]: D.
Handkiewicz-Junak
, M.
Świerniak
, D.
Rusinek
, M.
Oczko-Wojciechowska
, G.
Dom
, C.
Maenhaut
, K.
Unger
, V.
Detours
, T.
Bogdanova
, G.
Thomas
, I.
Likhtarov
, Roman
Jaksik
, M.
Kowalska
, E.
Chmielnik
, M.
Jarząb
, Andrzej
Świerniak
, B.
Jarząb
.
-
Eur. J. Nucl. Med. Mol. Imaging
2016 vol. 43 iss. 7
, s. 1267-1277, bibliogr. 50 poz..
Impact Factor
7.277.
Punktacja MNiSW
45.000
rak brodawkowaty tarczycy
;
młodzież
;
dzieci
;
promieniowanie
;
ekspresja genów
;
transkryptom
papillary thyroid cancer
;
adolescents
;
children
;
radiation
;
gene expression
;
transcriptome
35/102
Nr opisu:
0000106556
Integrated system supporting research on environment related cancers.
[Aut.]: Wojciech
Bensz
, Damian
Borys
, Krzysztof
Fujarewicz
, Kinga*
Herok
, Roman
Jaksik
, Marcin*
Krasucki
, Agata*
Kurczyk
, Kamil
Matusik
, Dariusz
Mrozek
, Magdalena*
Ochab
, Marcin
Pacholczyk
, Justyna*
Pieter
, Krzysztof
Puszyński
, Krzysztof
Psiuk-Maksymowicz
, Sebastian
Student
, Andrzej
Świerniak
, Jarosław
Śmieja
.
W:
Recent developments in intelligent information and database systems
. Pt 1. Eds. Dariusz Król, Lech Madeyski, Ngoc Thanh Nguyen. Berlin : Springer International Publishing, 2016
, s. 399-409 (
Studies in Computational Intelligence
; vol. 642 1860-949X)
nowotwór
;
system zintegrowany
;
hurtownia danych
cancer
;
integrated system
;
data warehouses
36/102
Nr opisu:
0000102420
Nucleotide composition based measurement bias in high throughput gene expression studies.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Wojciech
Bensz
, Jarosław
Śmieja
.
W:
Man-machine interactions 4
. 4th International Conference on Man-Machine Interactions, ICMMI 2015, Kocierz Pass, Poland, October 6-9, 2015. Eds. Aleksandra Gruca, Agnieszka Brachman, Stanisław Kozielski, Tadeusz Czachórski. Berlin : Springer, 2016
, s. 205-214, bibliogr. 15 poz. (
Advances in Intelligent Systems and Computing
; vol. 391 2194-5357)
mikromacierz
;
ekspresja genów
;
badania o dużej wydajności
microarray
;
gene expression
;
high-throughput studies
;
microarray probes sequences
37/102
Nr opisu:
0000114185
Platform for remote testing and analyzing of biomedical data.
[Aut.]: Krzysztof
Psiuk-Maksymowicz
, Damian
Borys
, Roman
Jaksik
, Sebastian
Student
, Dariusz
Mrozek
, Krzysztof
Fujarewicz
, Andrzej
Świerniak
.
W:
XXth Gliwice Scientific Meetings 2016, Gliwice, November 18-19, 2016 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2016
, s. 18
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2016.pdf [dostęp 2 marca 2017]
38/102
Nr opisu:
0000114240
Stability of reference gene expression in cells exposed to stressing factors.
[Aut.]: E.
Marek
, Anna
Lalik
, Roman
Jaksik
.
W:
XXth Gliwice Scientific Meetings 2016, Gliwice, November 18-19, 2016 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2016
, s. 107
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2016.pdf [dostęp 3 marca 2017]
39/102
Nr opisu:
0000099239
A model for the effects of ionizing radiation on microRNA-mediated regulation of mRNA levels in cells.
[Aut.]: Marzena*
Dołbniak
, Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
, Krzysztof
Fujarewicz
.
W:
19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology
. RECOMB 2015, Warsaw, Poland, April 12-14, 2015. Book of abstracts. [B.m.] : [b.w.], 2015
, s. 37-38
40/102
Nr opisu:
0000106904
Analiza fenotypu mutatora związanego z polimerazą epsilon.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Marek
Kimmel
.
W:
Śląskie Spotkania Naukowe
. Ustroń, 15-17.05.2015 [online]. Stowarzyszenie na Rzecz Wspierania Badań nad Rakiem. [B.m.] : [b.w.], 2015
, (plik pdf) s. 17
Dostępny w Internecie: http://www.biofarma.polsl.pl/images/pliki/II_SlaskieSpotkaniaNaukowe2015v2.pdf [dostęp 22 czerwca 2016]
fenotyp
;
mutacja
;
polimeraza epsilon
phenotype
;
mutation
;
polymerase epsilon
41/102
Nr opisu:
0000099297
Cancer - a story on fault propagation in gene-cellular networks.
[Aut.]: Damian
Borys
, Roman
Jaksik
, M.
Krześlak
, Jarosław
Śmieja
, Andrzej
Świerniak
.
W:
Propagation phenomena in real world networks
. Eds. Dariusz Król, Damien Fay, Bogdan Gabryś. Berlin : Springer International Publishing, 2015
, s. 225-256, bibliogr. 109 poz. (
Intelligent Systems Reference Library
; vol. 85 1868-4394)
42/102
Nr opisu:
0000102377
Cross talk between cytokine and hyperthermia-induced pathways: identification of different subsets of NF-kB-dependent genes regulated by TNFα and heat shock.
[Aut.]: Patryk
Janus
, Tomasz*
Stokowy
, Roman
Jaksik
, K.
Szołtysek
, L.
Handschuh
, J.
Podkowiński
, W.
Widlak
, Marek
Kimmel
, P.
Widlak
.
-
Mol. Genet. Genomics
2015 vol. 290 iss. 5
, s. 1979-1990, bibliogr. 58 poz..
Impact Factor
2.622.
Punktacja MNiSW
25.000
ChIP-seq
;
HSF1
;
szok cieplny
;
mikromacierz
;
NF-kB
;
miejsca wiązania czynnika transkrypcji
ChIP-seq
;
HSF1
;
heat shock
;
microarray
;
NF-kB
;
transcription factor binding
43/102
Nr opisu:
0000103987
Crosstalk between cytokine and hyperthermia induced pathways: identification of different subsets of NF-κB-dependent genes regulated by TNF-α and heat shock.
[Aut.]: Patryk
Janus
, T.
Stokowy
, Roman
Jaksik
, K.
Szoltysek
, L.
Handschuh
, J.
Podkowiński
, W.
Widlak
, Marek
Kimmel
, P.
Widlak
.
W:
XIXth Gliwice Scientific Meetings 2015, Gliwice, November 20-21, 2015 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2015
, (plik pdf) s. 89
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2015.pdf [dostęp 25 stycznia 2016]
44/102
Nr opisu:
0000101688
Microarray experiments and factors which affect their reliability.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Marta
Iwanaszko
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
, Marek
Kimmel
.
-
Biol. Direct
2015 vol. 10
, art. no. 46, bibliogr. 103 poz..
Impact Factor
3.016.
Punktacja MNiSW
35.000
mikromacierz
;
wstępne przetwarzanie danych mikromacierzy
;
kontrola jakości
;
profilowanie transkryptomu
;
odchylenie pomiaru
microarray
;
microarray pre-processing
;
quality control
;
transcriptome profiling
;
measurement bias
45/102
Nr opisu:
0000104002
P53 protein-dependent changes in the glycosylation patterns of cancer cells.
[Aut.]: Anna
Lalik
, Roman
Jaksik
, Krzysztof
Puszyński
.
W:
XIXth Gliwice Scientific Meetings 2015, Gliwice, November 20-21, 2015 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2015
, (plik pdf) s. 105
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2015.pdf [dostęp 25 stycznia 2016]
46/102
Nr opisu:
0000099366
Solvary: a tool for the study of complex intracellular signalling pathways.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Krzysztof
Puszyński
.
W:
19th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology
. RECOMB 2015, Warsaw, Poland, April 12-14, 2015. Book of abstracts. [B.m.] : [b.w.], 2015
, s. 97
47/102
Nr opisu:
0000090874
An efficient algorithm for microarray probes re-annotation.
[Aut.]: Paweł
Foszner
, Aleksandra Helena
Gruca
, Andrzej
Polański
, Michał
Marczyk
, Roman
Jaksik
, Joanna
Polańska
.
W:
Transactions on computational collective intelligence XIII
. Eds: Ngoc-Thanh Nguyen, Hoai An Le Thi. Berlin : Springer, 2014
, s. 201-218, bibliogr. 10 poz. (
Lecture Notes in Computer Science
; vol. 8342 0302-9743)
re-adnotacja
;
mikromacierz
;
wyrażenie danych
;
Affymetrix
;
klasyfikacja
re-annotation
;
microarray
;
expression data
;
Affymetrix
;
classification
48/102
Nr opisu:
0000099627
Can Mdm2 regulate the glycosylation pathway in human cancer cells?.
[Aut.]: Anna
Lalik
, Roman
Jaksik
.
W:
Glyco-T 2014
. 9th International Symposium on Glycosyltransferases, Porto, Portugal, 2014.06.18-2014.06.21. Porto : [b.w.], 2014
, s. 70
49/102
Nr opisu:
0000099356
Controlling the intracellular processes.
[Aut.]: Krzysztof
Puszyński
, Roman
Jaksik
, Anna
Lalik
.
W:
Proceedings of the 19th IFAC World Congress, Cape Town, South Africa, August 24-29, 2014 [online]
. Ed. Edward Boje, Xiaohua Xia. Oxford : Elsevier, 2014
, (plik pdf) s. 11524-11529, bibliogr. 23 poz. (
IFAC Proceedings Volumes
; vol. 47, iss. 3 1474-6670)
Dostępny w Internecie: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1474667016434488 [dostęp 12 października 2016]
50/102
Nr opisu:
0000096483
MicroRNAs and reactive oxygen species: are they in the same regulatory circuit?.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Anna
Lalik
, Magdalena
Skonieczna
, Artur*
Cieślar-Pobuda
, Sebastian
Student
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
-
Mutat. Res. - Genet. Toxicol. Environ. Mutagen.
2014 vol. 764-765
, s. 64-71, bibliogr. 55 poz..
Impact Factor
2.415.
Punktacja MNiSW
30.000
interferencja RNA
;
miRNA
;
promieniowanie jonizujące
;
reaktywne formy tlenu
;
mikromacierz
;
analiza sekwencji nukleotydów
RNA interference
;
miRNA
;
ionizing radiation
;
reactive oxygen species
;
microarray
;
nucleotide sequence analysis
51/102
Nr opisu:
0000099622
Prediction of glycosylation changes in irradiated cancer cells using the application GlycoGene.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Anna
Lalik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
27th International Carbohydrate Symposium, Bangalore, India 2014.01.12-2014.01.17
. Bangladore : [b.w.], 2014
, s. 197
52/102
Nr opisu:
0000099630
Rola białka p53 w regulacji ekspresji glikozylotransferaz w komórkach nowotworowych HCT116.
[Aut.]: Anna
Lalik
, Roman
Jaksik
, Krzysztof
Puszyński
.
W:
Automatyzacja procesów dyskretnych
. Teoria i zastosowania. T. 2. Pod red. Andrzeja Świerniaka i Jolanty Krystek. Gliwice : Wydaw. Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego, 2014
, s. 165-172, bibliogr. 15 poz.
białko p53
;
komórki nowotworowe
;
komórki HCT116
;
glikozylacja
p53 protein
;
cancer cells
;
HCT116 cells
;
glycosidation
53/102
Nr opisu:
0000096749
Sources of high variance between probe signals in affymetrix short oligonucleotide microarrays.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Michał
Marczyk
, Joanna
Polańska
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
-
Sensors
2014 vol. 14 iss. 1
, s. 532-548, bibliogr. 27 poz..
Impact Factor
2.245.
Punktacja MNiSW
30.000
mikromacierz
;
zawartość GC
;
CDF
;
g-kwadrupleks
;
oligo (dT)
microarray
;
GC-content
;
custom CDF
;
g-quadruplex
;
oligo(dT)
54/102
Nr opisu:
0000096324
The role of are and MRE based gene regulation in cellular response to ionizing radiation.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Dorota*
Hudy
, Krzysztof*
Biernacki
, Karolina*
Gajda
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
XVIIIth Gliwice Scientific Meetings, November 21-22, 2014 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2014
, s. 82
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2014.pdf [dostęp 14 kwietnia 2020]
55/102
Nr opisu:
0000128002
Uniwersalny kalibrator dla potrzeb estymacji ilości molekuł transkryptu.
[Aut.]: Arkadiusz
Biernacki
, Dorota*
Hudy
, Roman
Jaksik
, Magdalena
Skonieczna
.
W:
Automatyzacja procesów dyskretnych
. Teoria i zastosowania. T. 2. Pod red. Andrzeja Świerniaka i Jolanty Krystek. Gliwice : Wydaw. Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego, 2014
, s. 41-49, bibliogr. 9 poz.
modelowanie procesów biologicznych
;
PCR
;
RT-QPCR
;
krzywa kalibracji
modelling of biological processes
;
PCR
;
RT-QPCR
;
calibration curve
56/102
Nr opisu:
0000099623
UVC radiation-induced changes in cell surface glycosylation patterns.
[Aut.]: Anna
Lalik
, Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
27th International Carbohydrate Symposium, Bangalore, India 2014.01.12-2014.01.17
. Bangladore : [b.w.], 2014
, s. 178
57/102
Nr opisu:
0000090353
A mathematical model for prediction of changes in mRNA-miRNA interference after irradiation.
[Aut.]: Danuta*
Gaweł
, Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
, Krzysztof
Fujarewicz
.
W:
XVIIth Gliwice Scientific Meetings, November 15-16, 2013 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2013
, (plik pdf) s. 169
Dostępny w Internecie: http://www.bioinformatics.aei.polsl.pl/gsn/GSN_2013.pdf [dostęp 10 kwietnia 2013]
58/102
Nr opisu:
0000090547
Adaptive filtering of microarray gene expression data based on Gaussian mixture decomposition.
[Aut.]: Michał
Marczyk
, Roman
Jaksik
, Andrzej
Polański
, Joanna
Polańska
.
-
BMC Bioinformatics
2013 vol. 14 art. nr 101
, s. 1-12, bibliogr. 24 poz..
Impact Factor
2.672.
Punktacja MNiSW
35.000
59/102
Nr opisu:
0000086171
Analiza procesów regulacji ekspresji genów w komórkach poddanych działaniu promieniowania jonizującego. Rozprawa doktorska.
[Aut.]: Roman
Jaksik
.
Gliwice, 2013, 135 s., bibliogr. 39 poz.
Politechnika Śląska. Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki. Promotor: prof. dr hab. Joanna* Rzeszowska-Wolny
regulacja ekspresji genów
;
microRNA
;
mikromacierz
regulation of gene expression
;
microRNA
;
microarray
60/102
Nr opisu:
0000084184
Autophagy, apoptosis, mitoptosis and necrosis: interdependence between those pathways and effects on cancer.
[Aut.]: W.
Chaabane
, S. D.
User
, M.
El-Gazzah
, Roman
Jaksik
, E.
Sajjadi
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
, Marek
Łos
.
-
Arch. Immunol. Ther. Exp.
2013 vol. 61 iss. 1
, s. 43-58, bibliogr. 143 poz..
Impact Factor
2.818.
Punktacja MNiSW
25.000
AMPK
;
Hsp-70
;
Mdm2
;
mitochondrium
;
mTOR
;
RIPK
;
PARP-1
;
PKC-delta
;
TNF
;
VHL
AMPK
;
Hsp-70
;
Mdm2
;
mitochondrion
;
mTOR
;
RIPK
;
PARP-1
;
PKC-delta
;
TNF
;
VHL
61/102
Nr opisu:
0000090354
GC-content bias in short oligonucleotide microarray studies.
[Aut.]: Roman
Jaksik
.
W:
XVIIth Gliwice Scientific Meetings, November 15-16, 2013 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2013
, (plik pdf) s. 170
Dostępny w Internecie: http://www.bioinformatics.aei.polsl.pl/gsn/GSN_2013.pdf [dostęp 10 kwietnia 2013]
62/102
Nr opisu:
0000090167
Involvement of reactive oxygen species and microRNAs in cellular response to oxidative stress.
[Aut.]: Izabella
Ślęzak-Prochazka
, Karolina*
Gajda
, Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
XVIIth Gliwice Scientific Meetings, November 15-16, 2013 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2013
, (plik pdf) s. 138
Dostępny w Internecie: http://www.bioinformatics.aei.polsl.pl/gsn/GSN_2013.pdf [dostęp 10 kwietnia 2013]
63/102
Nr opisu:
0000090175
MiR-mask as a tool for the regulation of p53-Mdm2 intracellular pathways.
[Aut.]: Anna
Lalik
, Roman
Jaksik
, Krzysztof
Puszyński
.
W:
XVIIth Gliwice Scientific Meetings, November 15-16, 2013 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2013
, (plik pdf) s. 151
Dostępny w Internecie: http://www.bioinformatics.aei.polsl.pl/gsn/GSN_2013.pdf [dostęp 10 kwietnia 2013]
64/102
Nr opisu:
0000090136
Negative regulation og the NFκB signaling pathway by the heat shock transcription factor 1.
[Aut.]: P.
Janus
, M.
Kalinowska-Herok
, K.
Szołtysek
, Roman
Jaksik
, L.
Handschuh
, Marek
Kimmel
, P.
Widlak
.
W:
XVIIth Gliwice Scientific Meetings, November 15-16, 2013 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2013
, (plik pdf) s. 63
Dostępny w Internecie: http://www.bioinformatics.aei.polsl.pl/gsn/GSN_2013.pdf [dostęp 10 kwietnia 2013]
65/102
Nr opisu:
0000085409
Changes of fucosylation induced by Mirna-masking antisense oligonucleotides.
[Aut.]: Anna
Lalik
, Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
26th International Carbohydrate Symposium, ICS 2012, Madrid, 22-27.02.2012
. [B.m.] : [b.w.], 2012
, s. F101
66/102
Nr opisu:
0000097448
Co-regulation of NF-kappaB sygnaling pathway by the active form of Heat Shock Factor 1.
[Aut.]: Patryk
Janus
, M.
Kalinowska-Herok
, W.
Pigłowski
, K.
Szołtysek
, Roman
Jaksik
, Krzysztof
Puszyński
, Marek
Kimmel
, P.
Widlak
.
W:
22nd IUBMB & 37th FEBS Congress, Seville, Spain, September 4-9, 2012
. Oxford : Wiley-Blackwell Publishing, 2012
, s. 163 (
FEBS Journal
; vol. 279, suppl. 1 1742-464X)
67/102
Nr opisu:
0000085055
GlycoGene: a tool for the assessment of alterations in glycosylation patterns.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Anna
Lalik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
8th International Symposium on Glycosyltransferases
. GlycoT 2012, Hannover, Germany, 05-09.06.2012. Hannover : [b.w.], 2012
, s. B23
68/102
Nr opisu:
0000078303
NucleoSeq 2.0 an enchanted web services client applicable to complex nucleotide sequence analysis tasks.
[Aut.]: Roman
Jaksik
.
W:
XVIth Gliwice Scientific Meetings, November 16-17, 2012 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2012
, (plik pdf) s. 53
Dostępny w Internecie: http://www.bioinformatics.aei.polsl.pl/gsn/GSN_2012.pdf [dostęp 21 lutego 2013]
69/102
Nr opisu:
0000078290
Quality assessment of the probes placed on the Affymetrix Mouse430_2 microarray.
[Aut.]: Anna*
Cichońska
, Roman
Jaksik
, Joanna
Polańska
.
W:
XVIth Gliwice Scientific Meetings, November 16-17, 2012 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2012
, (plik pdf) s. 49
Dostępny w Internecie: http://www.bioinformatics.aei.polsl.pl/gsn/GSN_2012.pdf [dostęp 21 lutego 2013]
70/102
Nr opisu:
0000082965
Regulation of p53 by siRNA in radiation treated cells - simulation studies.
[Aut.]: Krzysztof
Puszyński
, Roman
Jaksik
, Andrzej
Świerniak
.
-
Int. J. Appl. Math. Comput. Sci.
2012 vol. 22 no. 4
, s. 1011-1018, bibliogr. 26 poz..
Impact Factor
1.008.
Punktacja MNiSW
20.000
siRNA
;
p53
;
terapia skojarzona
siRNA
;
p53
;
combined therapy
71/102
Nr opisu:
0000078344
Regulation of P53 signaling pathway in malignant cells based on RNA interference.
[Aut.]: Krzysztof
Puszyński
, Roman
Jaksik
, Andrzej
Świerniak
.
W:
XVIth Gliwice Scientific Meetings, November 16-17, 2012 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2012
, (plik pdf) s. 58
Dostępny w Internecie: http://www.bioinformatics.aei.polsl.pl/gsn/GSN_2012.pdf [dostęp 21 lutego 2013]
72/102
Nr opisu:
0000071051
The distribution of GC nucleotides and regulatory sequence motifs in genes and their adjacent sequences.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
-
Gene
2012 vol. 492 iss. 2
, s. 375-381, bibliogr..
Impact Factor
2.196.
Punktacja MNiSW
25.000
analiza sekwencji
;
ARE
;
sekwencja kodująca
;
3'-UTRs
sequence analysis
;
ARE
;
coding sequence
;
3'-UTRs
73/102
Nr opisu:
0000078430
The influence of heat shock factor 1 on the NF-κB signalling pathway.
[Aut.]: P.
Janus
, M.
Kalinowska-Herok
, K.
Szołtysek
, Roman
Jaksik
, Marek
Kimmel
, P.
Widłak
.
W:
XVIth Gliwice Scientific Meetings, November 16-17, 2012 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2012
, (plik pdf) s. 77
Dostępny w Internecie: http://www.bioinformatics.aei.polsl.pl/gsn/GSN_2012.pdf [dostęp 21 lutego 2013]
74/102
Nr opisu:
0000084039
The role of RNA interference-based regulation of gene expression in cancer cells exposed to ionizing radiation.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Anna
Lalik
, Sebastian
Student
, Andrzej
Świerniak
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
-
Eur. J. Cancer
2012 vol. 48 suppl. 5
, s. S160-S161
Referat wygłoszony na: 22nd Biennial Congress of the European Association for Cancer Research.
Impact Factor
5.061.
Punktacja MNiSW
35.000
75/102
Nr opisu:
0000071398
A bioinformatics tool for the prediction of changes in glycosylation of cells after exposure to various stress conditions.
[Aut.]: Anna
Lalik
, Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
XXI International Symposium on Glycoconjugates
. GLYCO 21, Vienna, Austria, August 21-26, 2011. Abstracts. Berlin : Springer, 2011
, s. 336-337 (
Glycoconjugate Journal
;
vol. 28, nr 5
0282-0080)
76/102
Nr opisu:
0000071872
Cell cycle gene expression analysis in head and neck cancer suggests the existence of patients subpopulations with different molecular profiles.
[Aut.]: R.
Herok
, M.
Śnietura
, W.
Pigłowski
, Roman
Jaksik
, A.
Fiszer-Kierzkowska
, E.
Małusecka
, G.
Woźniak
, M.
Misiołek
, B.
Kolebach
, A.
Maciejewski
, C.
Szymczyk
, R.
Suwiński
.
W:
V Zjazd Polskiego Towarzystwa Radioterapii Onkologicznej, Gliwice, 17-18 maja 2011 r.
. Jaworze Górne : Wydaw. Kwieciński, 2011
, s. 64-65 (
Onkologia Info
; t. 8, nr 2 1895-0485)
77/102
Nr opisu:
0000083096
Computational model of siRNA regulation in p53 signaling pathway.
[Aut.]: Krzysztof
Puszyński
, Roman
Jaksik
.
W:
Proceedings of the XVII National Conference Applications of Mathematics to Biology and Medicine, Zakopane, September 1-6, 2011
. Warszawa : University of Warsaw. Institute of Applied Mathematics and Mechanics. Department of Mathematics, 2011
, s. 85-91, bibliogr. 21 poz.
78/102
Nr opisu:
0000071928
Discriminative gene selection in low dose radiotherapy microarray data for radiosensitivity profile search.
[Aut.]: Michał
Marczyk
, Roman
Jaksik
, Joanna
Polańska
, Andrzej
Polański
.
W:
Book of Abstracts of the 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology, Kraków, June 28 - July 2, 2011
. [B.m.] : [b.w.], 2011
, s. 632-633
79/102
Nr opisu:
0000071577
Efficient algorithm for microarray probes re-annotation.
[Aut.]: Paweł
Foszner
, Aleksandra Helena
Gruca
, Andrzej
Polański
, Michał
Marczyk
, Roman
Jaksik
, Joanna
Polańska
.
W:
Computational collective intelligence
. Technologies and applications. ICCCI 2011. Third international conference, Gdynia, Poland, September 21-23, 2011. Proceedings. Pt 2. Eds: P. Jędrzejewicz, N.T. Nguyen, K. Hoang. Berlin : Springer, 2011
, s. 281-289, bibliogr. 10 poz. (
Lecture Notes in Computer Science
; vol. 6923
Lecture Notes in Artificial Intelligence
; 0302-9743)
readnotacja
;
mikromacierz
;
Affymetrix
;
klasyfikacja
;
poziom ekspresji genów
re-annotation
;
microarray
;
Affymetrix
;
classification
;
gene expression data
80/102
Nr opisu:
0000071842
Efficient reannotation system for verifying genomic targets of DNA microarray probes.
[Aut.]: Paweł
Foszner
, Roman
Jaksik
, Aleksandra Helena
Gruca
, Joanna
Polańska
, Andrzej
Polański
.
W:
Abstracts of section talks at the 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology, Kraków, June 28 - July 2, 2011
. [B.m.] : [b.w.], 2011
, s. 26-27
81/102
Nr opisu:
0000071874
MicroImage as a tool for microarray image artifacts correction.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Michał
Marczyk
, Joanna
Polańska
.
W:
Abstracts of posters presented at the 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology, Kraków, June 28 - July 2, 2011
. [B.m.] : [b.w.], 2011
, s. 450-451
82/102
Nr opisu:
0000081224
Model prostego sterowania ścieżką sygnałową p53 przy użyciu siRNA.
[Aut.]: Krzysztof
Puszyński
, Roman
Jaksik
.
W:
Biocybernetyka i inżynieria biomedyczna
. XVII Krajowa konferencja, Gliwice/Tarnowskie Góry, 11-14 października 2011. Red. Wojciech Filipowski, Paweł Kostka. [B.m.] : [b.w.], 2011
, s. 36
Pełny tekst na CD-ROM
radioterapia
;
siRNA
;
ścieżka sygnału p53
radiotherapy
;
siRNA
;
p53 signal path
83/102
Nr opisu:
0000071875
The journey towards understanding the compositional properties of vertebrate genomes.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
15th Gliwice Scientific Meetings, November 18-19, 2011 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2011
, (plik pdf) s. 63
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2011.pdf [dostęp 19 grudnia 2014]
84/102
Nr opisu:
0000070202
A system for low level preprocessing of DNA microarray dat.
[Aut.]: Joanna
Polańska
, Michał
Marczyk
, Roman
Jaksik
.
W:
8th PTBi Workshop on Bioinformatics, Ustroń, October 1-3, 2010
. [B.m.] : [b.w.], 2010
, s. 9
85/102
Nr opisu:
0000063482
Bystander effects induced by medium from irradiated cells: similar transcriptome responses in irradiated and bystander K562 cells.
[Aut.]: R.
Herok
, M.
Konopacka
, Joanna
Polańska
, Andrzej
Świerniak
, J.
Rogoliński
, Roman
Jaksik
, R.
Hancock
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
-
Int. J. Radiat. Oncol. Biol. Phys.
2010 vol. 77 iss. 1
, s. 244-252, bibiogr. 54 poz..
Impact Factor
4.503
efekt przechodnia
;
promieniowanie jonizujące
;
mikromacierz
bystander effect
;
ionizing radiation
;
microarray
86/102
Nr opisu:
0000062963
Data mining in molecular biology: a journey from raw datasets to biologically meaningful conclusions.
[Aut.]: Roman
Jaksik
.
W:
XII International PhD Workshop
. OWD 2010, [Wisła, 23-26 October 2010]. Polish Society of Theoretical and Applied Electrotechnics [et al.]. [Gliwice] : Organizing Committe of the Symposium PPEE & Seminar BSE, 2010
, s. 265-270, bibliogr. 17 poz. (
Conference Archives PTETiS
; vol. 28)
87/102
Nr opisu:
0000070199
Discovery of genetic markers In patients over-responsive to low dose radiotherapy.
[Aut.]: Michał
Marczyk
, Roman
Jaksik
, Joanna
Polańska
, Andrzej
Polański
.
W:
8th PTBi Workshop on Bioinformatics, Ustroń, October 1-3, 2010
. [B.m.] : [b.w.], 2010
, s. 15
88/102
Nr opisu:
0000068975
Gene selection problem in identification of patients over-responsive to low dose radiotherapy.
[Aut.]: Michał
Marczyk
, Roman
Jaksik
, Joanna
Polańska
, Andrzej
Polański
.
W:
XIVth Gliwice Scientific Meetings 2010, Gliwice, 26-27.11.2010 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2010
, (plik pdf) s. 72
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2010.pdf [dostęp 19 grudnia 2014]
89/102
Nr opisu:
0000068439
Oxidative RNA damage and its potential role in cellular responses to radiation.
[Aut.]: Magdalena
Skonieczna
, Sebastian
Student
, Artur*
Cieślar-Pobuda
, R.
Herok
, Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
Abstracts of the 45th Meeting of the Polish Biochemical Society, Wisła, Poland, September 20th - 23rd, 2010
. Warszawa : [b.w.], 2010
, s. 131 (
Acta Biochimica Polonica
; vol. 57, suppl. 4 0001-527X)
RNA
;
radioterapia
;
leczenie nowotworów
RNA
;
radiotherapy
;
cancer therapy
90/102
Nr opisu:
0000063654
Position weight matrix model as a tool for the study of regulatory elements distribution across the DNA sequence.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
-
Arch. Control Sci.
2010 vol. 20 no. 4
, s. 491-501, bibliogr. 33 poz.
czynnik transkrypcyjny
;
TFBS
;
regulacja ekspresji genów
;
sekwencja regulacyjna
;
DNA
;
PWM
ranscription factor
;
TFBS
;
regulation of gene expression
;
regulatory sequence
;
DNA
;
PWM
91/102
Nr opisu:
0000070166
Prediction of glycans synthesised in exposed to ionizing radiation.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Anna
Lalik
, A.
Michalski
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
Automatyzacja procesów dyskretnych
. Teoria i zastosowania. T. 2. Pod red. Andrzeja Świerniaka i Jolanty Krystek. Gliwice : Wydaw. Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego, 2010
, s. 73-80, bibliogr. 10 poz.
struktura cukrów
;
ekspresja genów
;
glikan
sugars structure
;
gene expression
;
glycan
92/102
Nr opisu:
0000070177
Prediction of regulatory elements in DNA using position weight matrix models.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
Proceedings of the Sixteen National Conference on Application of Mathematics in Biology and Medicine, Krynica, 14-18 September 2010
. Eds: M. Ziółko, M. Bodnar, E. Kutafina. Kraków : AGH University of Science and Technology Press, 2010
, s. 53-58
93/102
Nr opisu:
0000068972
Regulation of gene expression by nucleic acid binding factors evolved by gain or loss of binding sites.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
Structural and functional diversity of the Eukaryotic genome
. International workshop, Brno, Czech Republic, October 14-16, 2010. Book of abstracts. Ed. by T. Bettecken, J. Fajkus, E. N. Trifonov. [B.m.] : [b.w.], 2010
, s. 53
analiza genomu
;
bioinformatyka
;
NucleoSeq
genome analysis
;
bioinformatics
;
NucleoSeq
94/102
Nr opisu:
0000068413
Transcripts from genes located in different isochores are differently regulated in cells exposed to ionizing radiation.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Andrzej
Świerniak
, J.
Jurka
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
-
Eur. J. Cancer Suppl.
2010 vol. 8 iss. 5
, s. 212
Zawiera materiały z: 1st Meeting of the European Association for Cancer Research Oslo, Norway
95/102
Nr opisu:
0000049972
Calculation of reliable transcript levels of annotated genes on the basis of multiple probe-sets in Affymetrix microarrays.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Joanna
Polańska
, R.
Herok
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
-
Acta Biochim. Pol.
2009 vol. 56 no. 2
, s. 271-277, bibliogr..
Impact Factor
1.262
transkrypcja
;
mikromacierz
;
Affymetrix
;
wykrywanie próbek odstających
;
program komputerowy NucleoDix
transcription
;
microarray
;
Affymetrix
;
outlier detection
;
NucleoDix computer program
96/102
Nr opisu:
0000058913
Can blood cells be important in bystander effects?. Bystander effects in lymphoblastoid cells.
[Aut.]: Joanna*
Rzeszowska
, J.
Łanuszewska
, A.
Gdowicz
, Magdalena
Skonieczna
, Roman
Jaksik
.
W:
XIIIth Gliwice Scientific Meetings 2009, Gliwice, November 20-21, 2009 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2009
, (plik pdf) s. 49
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2009.pdf [dostęp 22 grudnia 2014]
97/102
Nr opisu:
0000054878
Regulation of gene expression in cells exposed to ionizing radiation.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Ł.
Habowski
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
XI International PhD Workshop = XI Międzynarodowe Warsztaty Doktoranckie
. OWD 2009, [Wisła, 17-20 October 2009]. Polish Society of Theoretical and Applied Electrotechnics [et al.]. [Gliwice] : Organizing Committe of the Symposium PPEE & Seminar BSE, 2009
, s. 164-169, bibliogr. 44 poz. (
Archiwum Konferencji PTETiS
; vol. 26)
Toż na CD-ROM
98/102
Nr opisu:
0000058625
The elements of the systemic cellular response to stress. The regulation of transcript levels in cells exposed to ionizing radiation.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
The Wilhelm Bernhard Workshop
. 21st International Workshop on the Cell Nucleus, Ustroń, Poland 31 August - 4 September 2009. Program and abstracts. [B.m.] : [b.w.], 2009
, s. 61
99/102
Nr opisu:
0000058921
Using the NucleoSeq computer application to study the 3' non-coding nucleotide sequences of mRNAs coding for proteins that stimulate or inhibit apoptosis.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
Abstracts of the 44th Meeting of the Polish Biochemical Society, Łódź, Poland, September 16th - 19th, 2009
. Warszawa : [b.w.], 2009
, s. 35 (
Acta Biochimica Polonica
; vol. 56, suppl. 3 0001-527X)
100/102
Nr opisu:
0000048820
Estymacja poziomu szumu w eksperymentach z udziałem mikromacierzy Affymetrix.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Joanna
Polańska
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
X International PhD Workshop = X Międzynarodowe Warsztaty Doktoranckie
. OWD 2008, [Wisła, 18-21 October 2008]. Polish Society of Theoretical and Applied Electrotechnics [et al.]. [Gliwice] : Organizing Committe of the Symposium PPEE & Seminar BSE, 2008
, s. 85-90, bibliogr. 4 poz. (
Archiwum Konferencji PTETiS
; vol. 25)
Toż na CD-ROM
mikromacierz
;
Affymetrix
;
analiza genu
microarray
;
Affymetrix
;
gene analysis
101/102
Nr opisu:
0000049996
The 3' non-coding nucleotide sequence influences RNA stability in irradiated cells.
[Aut.]: Roman
Jaksik
, Joanna
Polańska
, Joanna*
Rzeszowska-Wolny
.
W:
Abstracts of the Congress of Biochemistry and Cell Biology
. 43rd Meeting of the Polish Biochemical Society and 10th Conference of Polish Cell Biology Society, Olsztyn, Poland, September 7th-11st, 2008. Warszawa : [b.w.], 2008
, s. 316 (
Acta Biochimica Polonica
; vol. 55, suppl. 3 0001-527X)
mRNA
;
radioterapia
;
destabilizacja
mRNA
;
radiotherapy
;
destabilization
102/102
Nr opisu:
0000050901
Transcription profile change after irradiation or in bystander cells.
[Aut.]: Joanna*
Rzeszowska-Wolny
, R.
Herok
, Roman
Jaksik
, Joanna
Polańska
, Maria**
Wideł
.
W:
XIIth Gliwice Scientific Meetings 2008, Gliwice, November 21-22, 2008 [online]
. [B.m.] : [b.w.], 2008
, (plik pdf) s. 32
Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2008.pdf [dostęp 22 grudnia 2014]
stosując format:
standardowy
pełny z etykietami pól
roboczy
redakcja skr.
redakcja peł.
kontrolny
Nowe wyszukiwanie