Wyniki wyszukiwania

Wynik wyszukiwania

1/14
Nr opisu: 0000133549
GTShark: genotype compression in large projects.
[Aut.]: Sebastian Deorowicz, Agnieszka Danek.
-Bioinformatics 2019 vol. 35 iss. 22, s. 4791-4793, bibliogr. 11 poz.. Impact Factor 5.610. Punktacja MNiSW 200.000

2/14
Nr opisu: 0000127867
Kmer-db: instant evolutionary distance estimation.
[Aut.]: Sebastian Deorowicz, Adam Gudyś, Maciej Długosz, Marek Kokot, Agnieszka Danek.
-Bioinformatics 2019 vol. 36 iss. 1, s. 133-136. Impact Factor 5.610. Punktacja MNiSW 200.000

3/14
Nr opisu: 0000123950
GTC: how to maintain huge genotype collections in a compressed form.
[Aut.]: Agnieszka Danek, Sebastian Deorowicz.
-Bioinformatics 2018 vol. 34 iss. 11, s. 1834-1840, bibliogr. 20 poz.. Impact Factor 4.531. Punktacja MNiSW 45.000

4/14
Nr opisu: 0000100774
GDC 2: compression of large collections of genomes.
[Aut.]: Sebastian Deorowicz, Agnieszka Danek, Marcin* Niemiec.
-Sci. Rep. 2015 vol. 5, art. 11565 s. 1-12, bibliogr. 32 poz.. Impact Factor 5.228. Punktacja MNiSW 40.000

5/14
Nr opisu: 0000103133
Inter-population differences in retrogene loss and expression in humans.
[Aut.]: M. Kabza, M. Kubiak, Agnieszka Danek, W. Rosikiewicz, Sebastian Deorowicz, Andrzej Polański, I. Makałowska.
-PLoS Genet. 2015 vol. 11 iss. 10, e1005579, s. 1-18, bibliogr. 41 poz.. Impact Factor 6.661. Punktacja MNiSW 45.000

6/14
Nr opisu: 0000101039
Algorithms for analysis of genomic data in compressed domain. Rozprawa doktorska.
[Aut.]: Agnieszka Danek.
Gliwice, 2014, 211 s., bibliogr. 279 poz.
Politechnika Śląska. Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki. Promotor: dr hab. inż. Sebastian Deorowicz

kompresja danych ; eksploracja danych ; bioinformatyka ; algorytm tekstowy ; dane genomowe ; indeks tekstowy ; wyszukiwanie wzorca

data compression ; data mining ; bioinformatics ; text algorithm ; genomic data ; text index ; string searching

7/14
Nr opisu: 0000088349
Bit-parallel algorithm for the block variant of the merged longest common subsequence problem.
[Aut.]: Agnieszka Danek, Sebastian Deorowicz.
W: Man-machine interactions 3. Eds: Aleksandra Gruca, Tadeusz Czachórski, Stanislaw Kozielski. Berlin : Springer, 2014, s. 173-181, bibliogr. 16 poz. (Advances in Intelligent Systems and Computing ; vol. 242 2194-5357)

porównanie sekwencji ; genom ; najdłuższy wspólny podciąg

sequence comparison ; genome ; longest common subsequence

8/14
Nr opisu: 0000096307
Evaluation and integration of functional annotation pipelines for newly sequenced organisms: the potato genome as a test case.
[Aut.]: D. Amar, I. Frades, Agnieszka Danek, T. Goldberg, S. K. Sharma, P. E. Hedley, E. Proux-Wera, E. Andreasson, R. Shamir, O. Tzfadia, E. Alexandersson.
-BMC Plant Biol. 2014 vol. 14, art. no. 329, bibliogr. 44 poz.. Impact Factor 3.813. Punktacja MNiSW 40.000

adnotacja funkcjonalna ; ontologia genowa ; ko-ekspresja genów ; ziemniak ; genomika

functional annotation ; gene ontology ; gene co-expression ; potato ; genomics

9/14
Nr opisu: 0000095825
Indexes of large genome collections on a PC.
[Aut.]: Agnieszka Danek, Sebastian Deorowicz, S. Grabowski.
-PLoS One 2014 vol. 9 iss. 9, e109384, s. 1-12, bibliogr. 38 poz.. Impact Factor 3.234. Punktacja MNiSW 40.000

10/14
Nr opisu: 0000092808
Bit-parallel algorithms for the merged longest common subsequence problem.
[Aut.]: Sebastian Deorowicz, Agnieszka Danek.
-Int. J. Found. Comput. Sci. 2013 vol. 24 iss. 8, s. 1281-1298, bibliogr. 23 poz.. Impact Factor 0.326. Punktacja MNiSW 15.000

równoległość na poziomie bitów ; najdłuższy wspólny podciąg ; najdłuższy scalony wspólny podciąg ; porównanie sekwencji

bit-parallelism ; longest common subsequence ; merged longest common subsequence ; sequence comparison

11/14
Nr opisu: 0000090198
Genome compression: a novel approach for large collections.
[Aut.]: Sebastian Deorowicz, Agnieszka Danek, S. Grabowski.
-Bioinformatics 2013 vol. 29 iss. 20, s. 2572-2578, bibliogr. 27 poz.. Impact Factor 4.621. Punktacja MNiSW 45.000

12/14
Nr opisu: 0000078295
Recycling of unmapped reads to improve knowledge about the human genome.
[Aut.]: Agnieszka Danek, M. Kabza, Sebastian Deorowicz, M. Szcześniak, W. Rosikiewicz, I. Makałowska, Andrzej Polański.
W: XVIth Gliwice Scientific Meetings, November 16-17, 2012 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2012, (plik pdf) s. 51
Dostępny w Internecie: http://www.bioinformatics.aei.polsl.pl/gsn/GSN_2012.pdf [dostęp 21 lutego 2013]

13/14
Nr opisu: 0000078420
Retrogenes - trash or treasure.
[Aut.]: I. Makałowska, M. Kabza, J. Ciomborowska, Agnieszka Danek, Sebastian Deorowicz, M. Szcześniak, W. Rosikiewicz, E. Kaja, Andrzej Polański.
W: XVIth Gliwice Scientific Meetings, November 16-17, 2012 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2012, (plik pdf) s. 40
Dostępny w Internecie: http://www.bioinformatics.aei.polsl.pl/gsn/GSN_2012.pdf [dostęp 26 lutego 2013]

14/14
Nr opisu: 0000072224
Algorithm for searching for approximate tandem repeats based on the Burrows-Wheeler transform.
[Aut.]: Agnieszka Danek, Rafał* Pokrzywa.
W: Book of Abstracts of the 8-th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology, and Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology, Kraków, June 28 - July 2, 2011. [B.m.] : [b.w.], 2011, s. 206-207, bibliogr. 4 poz.

stosując format: