| Nr opisu: | 0000131326 |
| Tytuł oryginału: | BioTest - remote platform for hypothesis testing and analysis of biomedical data. |
| Autorzy: | Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, Roman Jaksik, Aleksander Płaczek, Aleksandra Helena Gruca, Sebastian Student, Damian Borys, Dariusz Mrozek, Krzysztof Fujarewicz, Andrzej ¦wierniak. |
| ¬ródło: | W: Current trends in biomedical engineering and bioimages analysis. Proceedings of the 21st Polish Conference on Biocybernetics and Biomedical Engineering, Zielona Góra, Poland, 25-27 September 2019. Eds.: Józef Korbicz, Roman Maniewski, Krzysztof Patan, Marek Kowal. Cham : Springer, 2020, s. 152-165, bibliogr. 22 poz. |
| ISBN: | 978-3-030-29884-5978-3-030-29885-2 |
| Seria: | (Advances in Intelligent Systems and Computing ; vol. 1033 2194-5357) |
| Punktacja MNiSW: | 20.000 |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Springer; Scopus; Web of Science |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | bioinformatyka ; analiza danych biomedycznych ; integracja danych |
| Słowa kluczowe angielskie: | bioinformatics ; biomedical data analysis ; data integration |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Nr opisu: | 0000134963 |
| Tytuł oryginału: | Whole brain and cranial size adjustments in volumetric brain analyses of sex- and age-related trends |
| Autorzy: | M. Kijonka, Damian Borys, Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, Kamil Gorczewski, P. Wojcieszek, B. Kossowski, A. Marchewka, Andrzej ¦wierniak, M. Sokół, B. Bobek-Billewicz. |
| ¬ródło: | -Front. Neurosci. 2020 vol. 14, art. no. 278 s. 1-16, bibliogr. 85 poz. |
| Impact Factor: | 3.707 |
| Punktacja MNiSW: | 100.000 |
| p-ISSN: | 1662-453X |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | MRI ; analiza wolumetryczna ; badania płci ; starzenie się ; segmentacja na podstawie wokseli |
| Słowa kluczowe angielskie: | MRI ; volumetry analysis ; sex studies ; aging ; voxel based segmentation |
| Typ publikacji: | A |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Informacje o dostępie open-access: | open-access-text-version: FINAL_PUBLISHED open-access-licence: CC-BY open-access-release-time: AT_PUBLICATION open-access-article-mode: OPEN_JOURNAL |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000129980 |
| Tytuł oryginału: | A phantom study of new bias field correction method combining N3 and KHM for MRI imaging. |
| Autorzy: | Damian Borys, Wojciech Serafin, Mariusz Fr±ckiewicz, Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, Henryk Palus. |
| ¬ródło: | W: The 14th International Conference on Signal Image Technology & Internet Based Systems. SITIS 2018, 26-29 November 2018, Las Palmas de Gran Canaria, Spain. Eds.: Gabriella Sanniti di Baja, Luigi Gallo, Kokou Yetongnon, Albert Dipanda, Modesto Castrillon-Santana, Richard Chbeir. Piscataway : IEEE, 2019, s. 314-319, bibliogr. 15 poz. |
| ISBN: | 978-1-5386-9386-5978-1-5386-9385-8 |
| Punktacja MNiSW: | 20.000 |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Scopus; Web of Science |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | korekta niejednolitej intensywno¶ci ; MRI ; fantom |
| Słowa kluczowe angielskie: | intensity nonuniformity correction ; MRI ; phantom |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000129982 |
| Tytuł oryginału: | Breast lesion segmentation in DCE- MRI imaging. |
| Autorzy: | Mariusz Fr±ckiewicz, Z. Koper, Henryk Palus, Damian Borys, Krzysztof Psiuk-Maksymowicz. |
| ¬ródło: | W: The 14th International Conference on Signal Image Technology & Internet Based Systems. SITIS 2018, 26-29 November 2018, Las Palmas de Gran Canaria, Spain. Eds.: Gabriella Sanniti di Baja, Luigi Gallo, Kokou Yetongnon, Albert Dipanda, Modesto Castrillon-Santana, Richard Chbeir. Piscataway : IEEE, 2019, s. 308-313, bibliogr. 34 poz. |
| ISBN: | 978-1-5386-9386-5978-1-5386-9385-8 |
| Punktacja MNiSW: | 20.000 |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Scopus; Web of Science |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | DCE-MRI ; segmentacja zmian w piersi ; obrazowanie medyczne |
| Słowa kluczowe angielskie: | DCE-MRI ; breast lesion segmentation ; medical imaging |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000123954 |
| Tytuł oryginału: | Rigid and non-rigid registration algorithm evaluation in MRI for breast cancer therapy monitoring. |
| Autorzy: | Paweł Bzowski, Marta Danch-Wierzchowska, Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, R. Panek, Damian Borys. |
| ¬ródło: | W: Information technology in biomedicine. Proceedings 6th International Conference, ITIB 2018, Kamień ¦l±ski, Poland, June 18-20, 2018. Eds. Ewa Pietka, Pawel Badura, Jacek Kawa, Wojciech Wieclawek. Cham : Springer, 2019, s. 150-159 |
| ISBN: | 978-3-319-91210-3978-3-319-91211-0 |
| Seria: | (Advances in Intelligent Systems and Computing ; vol. 762 2194-5357) |
| Punktacja MNiSW: | 20.000 |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Springer; Scopus; Web of Science |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | MRI ; przetwarzanie obrazu ; rejestracja obrazu ; pier¶ |
| Słowa kluczowe angielskie: | MRI ; image processing ; image registration ; breast |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Nr opisu: | 0000132911 |
| Tytuł oryginału: | Algorytm elastycznej rejestracji obrazów rezonansu magnetycznego w monitorowaniu zmian raka piersi. |
| Tytuł w wersji angielskiej: | Non-rigid registration algorithm in MRI images for breast cancer therapy monitoring |
| Autorzy: | Paweł Bzowski, Marta Danch-Wierzchowska, Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, Damian Borys. |
| ¬ródło: | W: III Międzynarodowa Interdyscyplinarna Konferencja Doktorantów Uczelni Technicznych. InterTechDoc'2018, Gliwice-Ustroń, 2018. Red. Mirosław Bonek, Łukasz Kohlbrenner, Bartłomiej Sobel. Gliwice : Instytut Materiałów Inżynierskich i Biomedycznych. Wydział Mechaniczny Technologiczny. Politechnika ¦l±ska, 2018, s. 7-15, bibliogr. 6 poz. |
| ISBN: | 978-83-65138-23-1 |
| Seria: | (Prace Instytutu Materiałów Inżynierskich i Biomedycznych Politechniki ¦l±skiej w Gliwicach ; ) |
| Punktacja MNiSW: | 20.000 |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Słowa kluczowe polskie: | przetwarzanie obrazów ; rezonans magnetyczny ; piersi |
| Słowa kluczowe angielskie: | image processing ; magnetic resonance imaging ; breast |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | POL |
| Zasieg terytorialny: | K |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Informacje o dostępie open-access: | open-access-text-version: FINAL_PUBLISHED open-access-licence: OTHER open-access-release-time: AT_PUBLICATION open-access-article-mode: OTHER |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000118937 |
| Tytuł oryginału: | Functional interpretation of gene sets: semantic-based clustering of gene ontology terms on the BioTest platform. |
| Autorzy: | Aleksandra Helena Gruca, Roman Jaksik, Krzysztof Psiuk-Maksymowicz. |
| ¬ródło: | W: Man-machine interactions 5. 5th International Conference on Man-Machine Interactions, ICMMI 2017, Kraków, Poland, October 3-6, 2017. Eds. Aleksandra Gruca, Tadeusz Czachórski, Katarzyna Harezlak, Stanisław Kozielski, Agnieszka Piotrowska. Berlin : Springer International Publishing, 2018, s. 125-136, bibliogr. 33 poz. |
| ISBN: | 978-3-319-67791-0978-3-319-67792-7 |
| Seria: | (Advances in Intelligent Systems and Computing ; vol. 659 2194-5357) |
| Punktacja MNiSW: | 15.000 |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,7 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Springer; Scopus; Web of Science |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | ontologia genowa ; grupowanie ; podobieństwo semantyczne ; platforma BioTest ; mikromacierz DNA ; profilowanie molekularne ; wykładnia funkcjonalna |
| Słowa kluczowe angielskie: | gene ontology ; clustering ; semantic similarity ; BioTest platform ; DNA microarray ; molecular profiling ; functional interpretation |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000125348 |
| Tytuł oryginału: | Identification of factors that affect reproducibility of mutation calling methods in data originating from the next-generation sequencing. |
| Autorzy: | Roman Jaksik, Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, Andrzej ¦wierniak. |
| ¬ródło: | W: Computer and information sciences. 32nd International symposium, ISCIS 2018 held at the 24th IFIP World Computer Congress, WCC 2018, Poznan, Poland, September 20-21, 2018. Proceedings. Eds. Tadeusz Czachórski, Erol Gelenbe, Krzysztof Grochla, Ricardo Lent. Cham : Springer, 2018, s. 264-271, bibliogr. 18 poz. |
| ISBN: | 978-3-030-00839-0978-3-030-00840-6 |
| Seria: | (Communications in Computer and Information Science ; vol. 935 1865-0929) |
| Punktacja MNiSW: | 20.000 |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Springer; Scopus |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | analiza danych bioinformatycznych ; sekwencjonowanie nowej generacji ; mutacja somatyczna ; powtarzalno¶ć wyników ; sekwencjonowanie całoeksomowe |
| Słowa kluczowe angielskie: | bioinformatic data analysis ; next generation sequencing ; somatic mutation ; reproducibility of results ; whole exome sequencing |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000118736 |
| Tytuł oryginału: | Comparison of k-means related clustering methods for Nuclear Medicine images segmentation. |
| Autorzy: | Damian Borys, Paweł Bzowski, Marta Danch-Wierzchowska, Krzysztof Psiuk-Maksymowicz. |
| ¬ródło: | W: Ninth International Conference on Machine Vision (ICMV 2016), Nice, France, November 18, 2016. Eds. Antanas Verikas, Petia Radeva, Dmitry P. Nikolaev, Wei Zhang, Jianhong Zhou. Bellingham : SPIE, 2017, paper 1034118 |
| ISBN: | 978-1-5106-1132-0 |
| Seria: | (Proceedings of SPIE ; vol. 10341 0277-786X) |
| Punktacja MNiSW: | 20.000 |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Web of Science; Scopus |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | segmentacja obrazu ; PET ; medycyna nuklearna |
| Słowa kluczowe angielskie: | image segmentation ; PET ; nuclear medicine ; k-means |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Nr opisu: | 0000115872 |
| Tytuł oryginału: | Scalability of a genomic data analysis in the BioTest platform. |
| Autorzy: | Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, Dariusz Mrozek, Roman Jaksik, Damian Borys, Krzysztof Fujarewicz, Andrzej ¦wierniak. |
| ¬ródło: | W: Intelligent information and database systems. 9th Asian Conference, ACIIDS 2017, Kanazawa, Japan, April 3-5, 2017. Proceedings. Pt. 2. Eds. Ngoc Thanh Nguyen, Satoshi Tojo, Le Minh Nguyen, Bogdan Trawiński. Cham : Springer International Publishing, 2017, s. 741-752, bibliogr. 21 poz. |
| ISBN: | 978-3-319-54429-8978-3-319-54430-4 |
| Seria: | (Lecture Notes in Computer Science ; vol. 10192 Lecture Notes in Artificial Intelligence ; 0302-9743) |
| Punktacja MNiSW: | 20.000 |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,7 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Springer; Scopus; Web of Science |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | bioinformatyka ; skalowalno¶ć ; platforma obliczeniowa ; klaster HPC ; workload manager ; analiza danych NGS |
| Słowa kluczowe angielskie: | bioinformatics ; scalability ; computational platform ; HPC cluster ; workload manager ; NGS data analysis |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Nr opisu: | 0000106341 |
| Tytuł oryginału: | A holistic approach to testing biomedical hypotheses and analysis of biomedical data. |
| Autorzy: | Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, A. Płaczek, Roman Jaksik, Sebastian Student, Damian Borys, Dariusz Mrozek, Krzysztof Fujarewicz, Andrzej ¦wierniak. |
| ¬ródło: | W: Beyond databases, architectures and structures. Advanced technologies for data mining and knowledge discovery. 12th International conference, BDAS 2016, Ustroń, Poland, May 31 - June 3, 2016. Proceedings. Eds. Stanisław Kozielski, Dariusz Mrozek, Paweł Kasprowski, Bożena Małysiak-Mrozek, Daniel Kostrzewa. [B.m.] : Springer, 2016, s. 449-462, bibliogr. 24 poz. |
| ISBN: | 978-3-319-34098-2978-3-319-34099-9 |
| Seria: | (Communications in Computer and Information Science ; vol. 613 1865-0929) |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Scopus; Web of Science |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | baza danych NoSQL ; hurtownia danych ; Big Data ; ETL ; przetwarzanie danych biomedycznych ; MapReduce |
| Słowa kluczowe angielskie: | NoSQL database ; data warehouse ; Big Data ; ETL ; biomedical data processing ; MapReduce ; multiversion dynamic-schema |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Nr opisu: | 0000106556 |
| Tytuł oryginału: | Integrated system supporting research on environment related cancers. |
| Autorzy: | Wojciech Bensz, Damian Borys, Krzysztof Fujarewicz, Kinga* Herok, Roman Jaksik, Marcin* Krasucki, Agata* Kurczyk, Kamil Matusik, Dariusz Mrozek, Magdalena* Ochab, Marcin Pacholczyk, Justyna* Pieter, Krzysztof Puszyński, Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, Sebastian Student, Andrzej ¦wierniak, Jarosław ¦mieja. |
| ¬ródło: | W: Recent developments in intelligent information and database systems. Pt 1. Eds. Dariusz Król, Lech Madeyski, Ngoc Thanh Nguyen. Berlin : Springer International Publishing, 2016, s. 399-409 |
| ISBN: | 978-3-319-31276-7978-3-319-31277-4 |
| Seria: | (Studies in Computational Intelligence ; vol. 642 1860-949X) |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Web of Science |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | nowotwór ; system zintegrowany ; hurtownia danych |
| Słowa kluczowe angielskie: | cancer ; integrated system ; data warehouses |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Nr opisu: | 0000114185 |
| Tytuł oryginału: | Platform for remote testing and analyzing of biomedical data. |
| Autorzy: | Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, Damian Borys, Roman Jaksik, Sebastian Student, Dariusz Mrozek, Krzysztof Fujarewicz, Andrzej ¦wierniak. |
| ¬ródło: | W: XXth Gliwice Scientific Meetings 2016, Gliwice, November 18-19, 2016 [online]. [B.m.] : [b.w.], 2016, s. 18 |
| Organizator: | Association for the Support of Cancer Research, Maria Skłodowska-Curie Memorial Cancer Center and Institute of Oncology. Gliwice Branch, Silesian University of Technology |
| Uwagi: | Dostępny w Internecie: http://gsn.io.gliwice.pl/materials/GSN_2016.pdf [dostęp 2 marca 2017] |
| Typ publikacji: | K |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | K |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Informacje o dostępie open-access: | open-access-licence: OTHER |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000102722 |
| Tytuł oryginału: | Studium obliczeniowe wzrostu guza litego i angiogenezy. |
| Autorzy: | Mariusz* Nieć, Damian Borys, Krzysztof Psiuk-Maksymowicz. |
| ¬ródło: | W: Biocybernetyka i inżynieria biomedyczna. XIX Krajowa konferencja naukowa, Warszawa, 14-16 paĽdziernika 2015. Komitet Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej Polskiej Akademii Nauk, Polskie Towawarzystwo Inżynierii Biomedycznej, Instytut Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej im. M. Nałęcza PAN. Warszawa : Polska Akademia Nauk. Instytut Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej, 2015, s. 158, bibliogr. 6 poz. |
| ISBN: | 978-83-937303-2-2 |
| Słowa kluczowe polskie: | angiogeneza ; guz ; model dyskretny |
| Słowa kluczowe angielskie: | angiogenesis ; tumour ; discrete model |
| Typ publikacji: | K |
| Język publikacji: | POL |
| Zasieg terytorialny: | K |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Nr opisu: | 0000092131 |
| Tytuł oryginału: | Magnetic resonance angiogram processing and modelling of the cerebral vescular network. |
| Autorzy: | Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, Jarosław ¦mieja, Damian Borys. |
| ¬ródło: | W: BIOTECHNO 2014. The Sixth International Conference on Bioinformatics, Biocomputational Systems and Biotechnologies, Chamonix, France, 20-24 April 2014. [B.m.] : [b.w.], 2014, s. 59-62, bibliogr. 9 poz. |
| ISBN: | 978-1-61208-335-3 |
| Seria: | (BIOTECHNO International Conference on Bioinformatics, Biocomputational Systems and Biotechnologies ; 2308-4383) |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Słowa kluczowe polskie: | przetwarzanie obrazów medycznych ; segmentacja obrazu ; MRI ; angiografia ; naczynia mózgowe |
| Słowa kluczowe angielskie: | medical image processing ; image segmentation ; MRI ; angiography ; cerebral vasculature |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000092132 |
| Tytuł oryginału: | Parallel implementations of numerical simulation of the vascular solid tumour growth model under the action of therapeutic agents (chemo- and antyangiotherapy). |
| Autorzy: | Damian Borys, Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, Sebastian Student, Andrzej ¦wierniak. |
| ¬ródło: | W: BIOTECHNO 2014. The Sixth International Conference on Bioinformatics, Biocomputational Systems and Biotechnologies, Chamonix, France, 20-24 April 2014. [B.m.] : [b.w.], 2014, s. 48-51, bibliogr. 23 poz. |
| ISBN: | 978-1-61208-335-3 |
| Seria: | (BIOTECHNO International Conference on Bioinformatics, Biocomputational Systems and Biotechnologies ; 2308-4383) |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,2 |
| Słowa kluczowe polskie: | guz ; model wzrostu ; obliczenia równoległe ; interfejs transmisji wiadomo¶ci ; CUDA |
| Słowa kluczowe angielskie: | tumour ; growth model ; parallel computations ; message passing interface ; CUDA |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000091207 |
| Tytuł oryginału: | Modelowanie matematyczne wzrosty guza - aspekty implementacji równoległej. |
| Autorzy: | Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, Sebastian Student, Damian Borys. |
| ¬ródło: | W: Biocybernetyka i inżynieria biomedyczna. XVIII Krajowa konferencja naukowa, Gdańsk, 10-12 paĽdziernika 2013. Red. Adam Bujanowski, Jerzy Wtorek. Komitet Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej Polskiej Akademii Nauk, Polskie Towawrzystwo Inżynierii Biomedycznej, Katedra Inżynierii Biomedycznej. Wydział Elektroniki, Telekomunikacji i Informatyki. Politechnika Gdańska. Gdańsk : Katedra Inżynierii Biomedycznej. Wydział Elektroniki, Telekomunikacji i Informatyki. Politechnika Gdańska, 2013, s. 92 |
| ISBN: | 978-83-60779-22-4 |
| Słowa kluczowe polskie: | modelowanie numeryczne ; CUDA ; MPI |
| Słowa kluczowe angielskie: | numerical modelling ; CUDA ; MPI |
| Typ publikacji: | K |
| Język publikacji: | POL |
| Zasieg terytorialny: | K |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |