Nr opisu: | 0000130805 |
Tytuł oryginału: | Disentangling the complexity of low complexity proteins |
Autorzy: | P. Mier, L. Paladin, S. Tamana, S. Petrosian, B. Hajdu-Soltesz, A. Urbanek, Aleksandra Helena Gruca, D. Plewczyński, M. Grynberg, P. Bernado, Z. Gaspari, C. A. Ouzounis, V. J. Promponas, A. V. Kajava, J. M. Hancock, S. C. E. Tosatto, Z. Dosztanyi, M. A. Andrade-Navarro. |
¬ródło: | -Brief. Bioinform. 2020 vol. 21 iss. 2, s. 458-472, bibliogr. 95 poz. |
Impact Factor: | 8.990 |
Punktacja MNiSW: | 140.000 |
p-ISSN: | 1467-5463 |
e-ISSN: | 1477-4054 |
DOI: | |
Słowa kluczowe polskie: | niskozłożone fragmenty sekwencji białkowych ; bias kompozycyjny ; struktura ; nieuporz±dkowanie |
Słowa kluczowe angielskie: | low complexity regions ; composition bias ; structure ; disorder |
Typ publikacji: | A |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Informacje o dostępie open-access: | open-access-text-version: FINAL_PUBLISHED open-access-licence: CC-BY-NC open-access-release-time: AT_PUBLICATION open-access-article-mode: OPEN_JOURNAL |
Dostęp on-line: | |
Nr opisu: | 0000131983 |
Tytuł oryginału: | LCR-BLAST - a new modification of BLAST to search for similar low complexity regions in protein sequences. |
Autorzy: | Patryk Jarnot, J. Ziemska-Legięcka, M. Grynberg, Aleksandra Helena Gruca. |
¬ródło: | W: Man-machine interactions 6. 6th International Conference on Man-Machine Interactions, ICMMI 2019, Cracow, Poland, October 2-3, 2019. Eds. Aleksandra Gruca, Tadeusz Czachórski, Sebastian Deorowicz, Katarzyna Harężlak, Agnieszka Piotrowska. Berlin : Springer International Publishing, 2020, s. 169-180, bibliogr. 12 poz. |
ISBN: | 978-3-030-31963-2978-3-030-31964-9 |
Seria: | (Advances in Intelligent Systems and Computing ; vol. 1061 2194-5357) |
Punktacja MNiSW: | 20.000 |
Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
Bazy indeksuj±ce publikację: | Springer |
DOI: | |
Słowa kluczowe polskie: | niskozłożone fragmenty sekwencji białkowych ; sekwencje białkowe ; podobieństwo sekwencji ; BLAST |
Słowa kluczowe angielskie: | low complexity regions ; protein sequences ; sequence similarity ; BLAST |
Typ publikacji: | RK |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Dostęp on-line: | |
Nr opisu: | 0000135661 |
Tytuł oryginału: | LCRANNOTATIONSDB: baza adnotacji regionów o niskiej złożono¶ci w białkach. |
Autorzy: | Sylwia Szymańska, Dagmara Błaszczyk, Wiktria ¦liwińska, Hanna Słowik, Hanna Langer, Kinga Lucińska, Karolina Widzisz, Alicja Sta¶czak, Aleksandra Janas, Aleksandra Helena Gruca, M. Grynberg, Patryk Jarnot, J. Ziemska-Legięcka. |
¬ródło: | W: VII ¦l±skie Spotkania Naukowe, Gliwice, 29-30 maja 2020 r. Oprac. Magdalena Skonieczna. Politechnika ¦l±ska w Gliwicach, Narodowy Instytut Onkologii im. Marii Skłodowskiej-Curie. Państwowy Instytut Badawczy. Oddział w Gliwicach, Stowarzyszenie na Rzecz Wspierania Badań nad Rakiem. [B.m.] : [b.w.], 2020, s. 15 |
Typ publikacji: | K |
Język publikacji: | POL |
Zasieg terytorialny: | K |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Informacje o dostępie open-access: | open-access-text-version: FINAL_PUBLISHED open-access-licence: OTHER open-access-release-time: AT_PUBLICATION open-access-article-mode: PUBLISHER_WEBSITE |
Dostęp on-line: | |
Nr opisu: | 0000136472 |
Tytuł oryginału: | PlaToLoCo: the first web meta-server for visualization and annotation of low complexity regions in proteins |
Autorzy: | Patryk Jarnot, J. Ziemska-Legiecka, L. Dobson, M. Merski, P. Mier, M. A. Andrade-Navarro, J. M. Hancock, Z. Dosztanyi, L. Paladin, M. Necci, D. Piovesan, S. C. E. Tosatto, V. J. Promponas, M. Grynberg, Aleksandra Helena Gruca. |
¬ródło: | -Nucl. Acids Res. 2020 vol. 48 iss. W1, s. W77-W84, bibliogr. 52 poz. |
Impact Factor: | 11.501 |
Punktacja MNiSW: | 200.000 |
p-ISSN: | 0305-1048 |
e-ISSN: | 1362-4962 |
DOI: | |
Typ publikacji: | A |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Informacje o dostępie open-access: | open-access-text-version: FINAL_PUBLISHED open-access-licence: CC-BY open-access-release-time: AT_PUBLICATION open-access-article-mode: OPEN_JOURNAL |
Dostęp on-line: | |
Nr opisu: | 0000132190 |
Tytuł oryginału: | Quantitative conformational analysis of functionally important electrostatic interactions in the intrinsically disordered region of delta subunit of bacterial RNA polymerase |
Autorzy: | V. Kuban, P. Srb, H. Stegnerova, P. Padrta, M. Zachrdla, Z. Jasenakova, H. Sanderova, D. Vitovska, L. Krasny, T. Koval', J. Dohnalek, J. Ziemska-Legiecka, M. Grynberg, Patryk Jarnot, Aleksandra Helena Gruca, M. Ringkjobing Jensen, M. Blackledge, L. Zidek. |
¬ródło: | -J. Am. Chem. Soc. 2019 vol. 141 iss. 42, s. 16817-16828 |
Impact Factor: | 14.612 |
Punktacja MNiSW: | 200.000 |
p-ISSN: | 0002-7863 |
e-ISSN: | 1520-5126 |
DOI: | |
Typ publikacji: | A |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Nr opisu: | 0000132192 |
Tytuł oryginału: | Tandem repeats lead to sequence assembly errors and impose multi-level challenges for genome and protein databases |
Autorzy: | O. K. Torresen, B. Star, P. Mier, M. A. Andrade-Navarro, A. Bateman, Patryk Jarnot, Aleksandra Helena Gruca, M. Grynberg, A. V. Kajava, V. J. Promponas, M. Anisimova, K. S. Jakobsen, D. Linke. |
¬ródło: | -Nucl. Acids Res. 2019 vol. 47 iss. 21, s. 10994-11006, bibliogr. 136 poz. |
Impact Factor: | 11.501 |
Punktacja MNiSW: | 200.000 |
p-ISSN: | 0305-1048 |
e-ISSN: | 1362-4962 |
DOI: | |
Typ publikacji: | A |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Informacje o dostępie open-access: | open-access-text-version: FINAL_PUBLISHED open-access-licence: CC-BY open-access-release-time: AT_PUBLICATION open-access-article-mode: OPEN_JOURNAL |
Dostęp on-line: | |
Nr opisu: | 0000132764 |
Tytuł oryginału: | GBSC: Method for clustering proteins by repeats in sequences. |
Autorzy: | Patryk Jarnot, J. Ziemska, M. Grynberg, Aleksandra Helena Gruca. |
¬ródło: | W: XI Symposium of Polish Bioinformatics Society, September 5-7, 2018, Wrocław, Poland. Book of abstracts. [B.m.] : [b.w.], 2018, s. 36, bibliogr. 2 poz. |
Typ publikacji: | K |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | K |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Informacje o dostępie open-access: | open-access-text-version: FINAL_PUBLISHED open-access-licence: OTHER open-access-release-time: AT_PUBLICATION open-access-article-mode: OTHER |
Dostęp on-line: | |
Nr opisu: | 0000132767 |
Tytuł oryginału: | MotifLCR: A new method for clustering low complexity regions. |
Autorzy: | J. Ziemska, Patryk Jarnot, Aleksandra Helena Gruca, M. Grynberg. |
¬ródło: | W: XI Symposium of Polish Bioinformatics Society, September 5-7, 2018, Wrocław, Poland. Book of abstracts. [B.m.] : [b.w.], 2018, s. 68, bibliogr. 2 poz. |
Typ publikacji: | K |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | K |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Informacje o dostępie open-access: | open-access-text-version: FINAL_PUBLISHED open-access-licence: OTHER open-access-release-time: AT_PUBLICATION open-access-article-mode: OTHER |
Dostęp on-line: | |