| Nr opisu: | 0000135042 |
| Tytuł oryginału: | Analysis of factors affecting the precision of gene expression measurement methods. |
| Autorzy: | Anna Lalik, Krzysztof Puszyński, Roman Jaksik. |
| ¬ródło: | W: 2019 13th International Conference on Signal Processing and Communication Systems (ICSPCS), Gold Coast, Australia, December 16-18, 2019. Proceedings. Eds.: Tadeusz A. Wysocki & Beata J. Wysocki. Piscataway : Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2019, s. 1-5, bibliogr. 19 poz. |
| ISBN: | 978-1-7281-2195-6978-1-7281-2194-9 |
| Punktacja MNiSW: | 20.000 |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,4 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | IEEE Xplore; INSPEC; Scopus |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | ekspresja genów ; RT-QPCR ; mikromacierz oligonukleotydowa ; sekwencjonowanie RNA |
| Słowa kluczowe angielskie: | gene expression ; RT-QPCR ; oligonucleotide microarray ; RNA sequencing |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000131190 |
| Tytuł oryginału: | Neuropathological and genomic characterization ofglioblastoma-induced rat model: How similar is it tohumans for targeted therapy? |
| Autorzy: | F. Sharifzad, H. Yasavoli-Sharahi, S. Mardpour, E. Fakharian, H. Nikuinejad, Y. Heydari, S. Mardpour, A. Taghikhani, R. Khellat, S. Vafaei, S. Kiani, S. Ghavami, Marek Łos, M. Noureddini, M. Ebrahimi, J. Verdi, A. A. Hamidieh. |
| ¬ródło: | -J. Cell. Physiol. 2019 vol. 234 iss. 12, s. 22493-22504, bibliogr. 57 poz. |
| Impact Factor: | 5.546 |
| Punktacja MNiSW: | 100.000 |
| p-ISSN: | 0021-9541 |
| e-ISSN: | 1097-4652 |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | terapia celowana ; ekspresja genów ; glejak wielopostaciowy ; interakcja białko-białko ; model szczura |
| Słowa kluczowe angielskie: | drug target therapy ; gene expression ; glioblastoma multiforme ; protein-protein interaction ; rat model |
| Typ publikacji: | A |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Nr opisu: | 0000121552 |
| Tytuł oryginału: | Detection of genetic aberrations in cancer driving signaling pathways based on joint analysis of heterogeneous genomics data. |
| Autorzy: | Roman Jaksik, Krzysztof Fujarewicz. |
| ¬ródło: | W: Proceedings of the International Conference on Information Technology & Systems. ICITS 18, Libertad City, Ecuador, January 10 - 12, 2018. Eds.: Alvaro Rocha, Teresa Guarda. Cham : Springer, 2018, s. 484-494, bibliogr. 13 poz. |
| ISBN: | 978-3-319-73449-1978-3-319-73450-7 |
| Seria: | (Advances in Intelligent Systems and Computing ; vol. 721 2194-5357) |
| Punktacja MNiSW: | 15.000 |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,6 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Scopus; Web of Science |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | ¶cieżka sygnalizacyjna ; sekwencjonowanie ; metylacja ; ekspresja genów ; zmiana liczby kopii ; wzajemna wył±czno¶ć |
| Słowa kluczowe angielskie: | signaling pathway ; sequencing ; methylation ; gene expression ; copy-number alteration ; mutual exclusivity |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000116991 |
| Tytuł oryginału: | Gene expression (mRNA) markers for differentiating between malignant and benign follicular thyroid tumours |
| Autorzy: | B. Wojtas, Aleksandra* Pfeifer, M. Oczko-Wojciechowska, J. Krajewska, A. Czarniecka, A. Kukulska, M. Eszlinger, T. Musholt, Tomasz* Stokowy, M. ¦wierniak, T. Tyszkiewicz, M. Halczok, S. Hauptmann, D. Lange, M. Jarz±b, R. Paschke, B. Jarz±b. |
| ¬ródło: | -Int. J. Mol. Sci. 2017 vol. 18 iss. 6, art. no. 1184 s. 1-19, bibliogr. 47 poz. |
| Impact Factor: | 3.687 |
| Punktacja MNiSW: | 30.000 |
| p-ISSN: | 1422-0067 |
| e-ISSN: | 1422-0067 |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | gruczolak pęcherzykowy tarczycy ; pęcherzykowy rak tarczycy ; ekspresja genów ; mikromacierz ; meta-analiza |
| Słowa kluczowe angielskie: | follicular thyroid adenoma ; follicular thyroid cancer ; gene expression ; microarray ; meta-analysis |
| Typ publikacji: | A |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Informacje o dostępie open-access: | open-access-text-version: FINAL_PUBLISHED open-access-licence: CC-BY open-access-release-time: AT_PUBLICATION open-access-article-mode: OPEN_JOURNAL |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000115847 |
| Tytuł oryginału: | Obszerna analiza danych wysoce zrównoleglonych dla identyfikacji biomarkerów białaczki. |
| Autorzy: | Wojciech Łabaj, Anna Papież, Joanna Polańska, Andrzej Polański. |
| ¬ródło: | W: ¦l±skie Spotkania Naukowe. Program IV ¦SN, Ustroń, 24-25 marca 2017 r.. Oprac. Magdalena Skonieczna. Association for the Support of Cancer Research, Politechnika ¦l±ska, Centrum Onkologii - Instytut im. Marii Skłodowskiej-Curie. Oddział w Gliwicach. [B.m.] : [b.w.], 2017, s. 28, bibliogr. 1 poz. |
| Słowa kluczowe polskie: | identyfikacja biomarkerów ; białaczka ; selekcja cech ; ekspresja genów ; korekta efektu paczki |
| Słowa kluczowe angielskie: | biomarker identification ; leukemia ; feature selection ; gene expression ; batch effect correction |
| Typ publikacji: | K |
| Język publikacji: | POL |
| Zasieg terytorialny: | K |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Informacje o dostępie open-access: | open-access-licence: OTHER |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000107387 |
| Tytuł oryginału: | Deep data analysis of a large microarray collection for leukemia biomarker identification. |
| Autorzy: | Wojciech Łabaj, Anna Papież, Joanna Polańska, Andrzej Polański. |
| ¬ródło: | W: 10th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics. Eds. Mohd Saberi Mohamad, Miguel P. Rocha, Florentino Fdez-Riverola, Francisco J. Dominguez Mayo, Juan F. De Paz. Cham : Springer, 2016, s. 71-79, bibliogr. 12 poz. |
| ISBN: | 978-3-319-40125-6978-3-319-40126-3 |
| Seria: | (Advances in Intelligent Systems and Computing ; vol. 477 2194-5357) |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Scopus; Springer; Web of Science |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | białaczka ; identyfikacja biomarkerów ; ekspresja genów ; wysoka wydajno¶ć ; efekt serii |
| Słowa kluczowe angielskie: | leukemia ; biomarker identification ; gene expression ; high-throughput ; batch effect |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Nr opisu: | 0000104515 |
| Tytuł oryginału: | Gene signature of the post-Chernobyl papillary thyroid cancer |
| Autorzy: | D. Handkiewicz-Junak, M. ¦wierniak, D. Rusinek, M. Oczko-Wojciechowska, G. Dom, C. Maenhaut, K. Unger, V. Detours, T. Bogdanova, G. Thomas, I. Likhtarov, Roman Jaksik, M. Kowalska, E. Chmielnik, M. Jarz±b, Andrzej ¦wierniak, B. Jarz±b. |
| ¬ródło: | -Eur. J. Nucl. Med. Mol. Imaging 2016 vol. 43 iss. 7, s. 1267-1277, bibliogr. 50 poz. |
| Impact Factor: | 7.277 |
| Punktacja MNiSW: | 45.000 |
| p-ISSN: | 1619-7070 |
| e-ISSN: | 1619-7089 |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | rak brodawkowaty tarczycy ; młodzież ; dzieci ; promieniowanie ; ekspresja genów ; transkryptom |
| Słowa kluczowe angielskie: | papillary thyroid cancer ; adolescents ; children ; radiation ; gene expression ; transcriptome |
| Typ publikacji: | A |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Informacje o dostępie open-access: | open-access-licence: CC-BY |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000102422 |
| Tytuł oryginału: | Integrative construction of gene signatures based on fusion of expression and ontology information. |
| Autorzy: | Wojciech Łabaj, Andrzej Polański. |
| ¬ródło: | W: Man-machine interactions 4. 4th International Conference on Man-Machine Interactions, ICMMI 2015, Kocierz Pass, Poland, October 6-9, 2015. Eds. Aleksandra Gruca, Agnieszka Brachman, Stanisław Kozielski, Tadeusz Czachórski. Berlin : Springer, 2016, s. 237-249, bibliogr. 27 poz. |
| ISBN: | 978-3-319-23436-6978-3-319-23437-3 |
| Seria: | (Advances in Intelligent Systems and Computing ; vol. 391 2194-5357) |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Scopus; Web of Science |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | ekspresja genów ; ontologia genowa ; analiza funkcjonalna ; podpis genowy |
| Słowa kluczowe angielskie: | gene expression ; gene ontology ; functional analysis ; gene signature |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Nr opisu: | 0000102420 |
| Tytuł oryginału: | Nucleotide composition based measurement bias in high throughput gene expression studies. |
| Autorzy: | Roman Jaksik, Wojciech Bensz, Jarosław ¦mieja. |
| ¬ródło: | W: Man-machine interactions 4. 4th International Conference on Man-Machine Interactions, ICMMI 2015, Kocierz Pass, Poland, October 6-9, 2015. Eds. Aleksandra Gruca, Agnieszka Brachman, Stanisław Kozielski, Tadeusz Czachórski. Berlin : Springer, 2016, s. 205-214, bibliogr. 15 poz. |
| ISBN: | 978-3-319-23436-6978-3-319-23437-3 |
| Seria: | (Advances in Intelligent Systems and Computing ; vol. 391 2194-5357) |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Scopus; Web of Science |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | mikromacierz ; ekspresja genów ; badania o dużej wydajno¶ci |
| Słowa kluczowe angielskie: | microarray ; gene expression ; high-throughput studies ; microarray probes sequences |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Nr opisu: | 0000107538 |
| Tytuł oryginału: | Transcriptomic and proteomic analysis of mouse radiation-induced acute myeloid leukaemia (AML) |
| Autorzy: | C. Badie, Agnieszka Błachowicz, Z. Barjaktarovic, R. Finnon, A. Michaux, H. Sarioglu, N. Brown, G. Manning, M. A. Benotmane, S. Tapio, Joanna Polańska, S. Bouffler. |
| ¬ródło: | -Oncotarget 2016 vol. 7 iss. 26, s. 40461-40480, bibliogr. 57 poz. |
| Impact Factor: | 5.168 |
| Punktacja MNiSW: | 40.000 |
| p-ISSN: | 1949-2553 |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | promieniowanie jonizuj±ce ; ostra białaczka szpikowa ; ekspresja genów ; ekspresja białka ; mysz |
| Słowa kluczowe angielskie: | ionizing radiation ; acute myeloid leukemia ; gene expression ; protein expression ; mouse |
| Typ publikacji: | A |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Informacje o dostępie open-access: | open-access-licence: CC-BY |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000099222 |
| Tytuł oryginału: | Is the identification of SNP-miRNA interactions supporting theprediction of human lymphocyte transcriptional radiation responses?. |
| Autorzy: | Marzena* Dołbniak, Joanna Żyła, S. Kabacik, G. Manning, C. Badie, G. Alsbeih, Joanna Polańska. |
| ¬ródło: | W: Proceedings of the International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms. BIOINFORMATICS 2015, Lisbon, Portugal, 12-15 January 2015. Eds. Oscar Pastor, Christine Sinoquet, Ana Fred, Hugo Gamboa, Dirk Elias. [B.m.] : SCITEPRESS, 2015, s. 243-250, bibliogr. 52 poz. |
| ISBN: | 978-989-758-070-3 |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Scopus |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | GWAS ; miRNA ; polimorfizm pojedynczego nukleotydu ; promieniowrażliwo¶ć ; ekspresja genów ; promieniowanie |
| Słowa kluczowe angielskie: | GWAS ; miRNA ; single nucleotide polymorphism ; radiosensitivity ; gene expression ; radiation |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000110241 |
| Tytuł oryginału: | Soft approach to identification of cohesive clusters in two gene representations. |
| Autorzy: | Michał Kozielski, Aleksandra Helena Gruca. |
| ¬ródło: | W: Knowledge-based and intelligent information & engineering systems. 18th Annual conferences. KES-2014, Gdynia, Poland, September 2014. Proceedings. Ed. by Piotr Jędrzejowicz, Ireneusz Czarnowski, Robert J. Howlett and Lakhmi C. Jain. Amsterdam : Elsevier, 2014, s. 281-289, bibliogr. 19 poz. |
| Seria: | (Procedia Computer Science ; vol. 35 1877-0509) |
| Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
| Bazy indeksuj±ce publikację: | Web of Science |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | blisko¶ć ; grupowanie rozmyte ; agregacja rozmyta ; ekspresja genów ; ontologia genowa |
| Słowa kluczowe angielskie: | proximity ; fuzzy clustering ; fuzzy aggregation ; gene expression ; gene ontology |
| Typ publikacji: | RK |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Informacje o dostępie open-access: | open-access-licence: CC-BY-NC-ND |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000094443 |
| Tytuł oryginału: | Molecular differential diagnosis of follicular thyroid carcinoma and adenoma based on gene expression profiling by using formalin-fixed paraffin-embedded tissues |
| Autorzy: | Aleksandra* Pfeifer, B. Wojtas, M. Oczko-Wojciechowska, A. Kukulska, A. Czarnecka, M. Eszlinger, T. Musholt, Tomasz* Stokowy, Michał* ¦wierniak, E. Stobiecka, D. Rusinek, T. Tyszkiewicz, M. Kowal, M. Jarz±b, S. Hauptmann, D. Lange, R. Paschke, B. Jarz±b. |
| ¬ródło: | -BMC Med. Genomics 2013 vol. 6, art. no 38, s. 1-10, bibliogr. 43 poz. |
| Impact Factor: | 3.914 |
| Punktacja MNiSW: | 35.000 |
| p-ISSN: | 1755-8794 |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | gruczolak pęcherzykowy tarczycy ; nowotwór pęcherzykowy tarczycy ; ekspresja genów ; mikromacierz |
| Słowa kluczowe angielskie: | follicular thyroid adenoma ; follicular thyroid cancer ; gene expression ; microarray |
| Typ publikacji: | A |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | Z |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Informacje o dostępie open-access: | open-access-licence: CC-BY |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000095652 |
| Tytuł oryginału: | Unsupervised analysis of follicular thyroid tumours transcriptome by oligonucleotide microarray gene expression profiling |
| Tytuł w wersji polskiej: | Analiza nienadzorowana transkryptomu nowotworów pęcherzykowych tarczycy za pomoc± profilowania ekspresji genów metod± mikromacierzy oligonukleotydowych |
| Autorzy: | B. Wojta¶, Aleksandra* Pfeifer, M. Jarz±b, A. Czarniecka, J. Krajewska, Michał* ¦wierniak, Tomasz* Stokowy, D. Rusinek, M. Kowal, J. Żebracka-Gala, T. Tyszkiewicz, M. Oczko-Wojciechowska, E. Stobiecka, D. Lange, R. Paschke, B. Jarz±b. |
| ¬ródło: | -Endokrynol. Pol. 2013 t. 64 nr 5, s. 328-334, bibliogr. 25 poz. |
| Impact Factor: | 1.208 |
| Punktacja MNiSW: | 15.000 |
| p-ISSN: | 0423-104X |
| DOI: | |
| Słowa kluczowe polskie: | rak pęcherzykowy tarczycy ; gruczolak pęcherzykowy ; ekspresja genów |
| Słowa kluczowe angielskie: | follicular thyroid carcinoma ; follicular adenoma ; gene expression |
| Typ publikacji: | A |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | K |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Informacje o dostępie open-access: | open-access-licence: CC-BY-NC-ND |
| Dostęp on-line: | |
| Nr opisu: | 0000070166 |
| Tytuł oryginału: | Prediction of glycans synthesised in exposed to ionizing radiation. |
| Tytuł w wersji polskiej: | Predykcja glikanów syntetyzowanych w komórkach poddanych działaniu promieniowania jonizuj±cego |
| Autorzy: | Roman Jaksik, Anna Lalik, A. Michalski, Joanna Rzeszowska-Wolny. |
| ¬ródło: | W: Automatyzacja procesów dyskretnych. Teoria i zastosowania. T. 2. Pod red. Andrzeja ¦wierniaka i Jolanty Krystek. Gliwice : Wydaw. Pracowni Komputerowej Jacka Skalmierskiego, 2010, s. 73-80, bibliogr. 10 poz. |
| Słowa kluczowe polskie: | struktura cukrów ; ekspresja genów ; glikan |
| Słowa kluczowe angielskie: | sugars structure ; gene expression ; glycan |
| Typ publikacji: | U |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | K |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Nr opisu: | 0000050076 |
| Tytuł oryginału: | Expression of glutathione S-transferase P1-1 (GSTP1) in cultured human cells and changes induced by ionizing radiation. |
| Autorzy: | A. Chwieduk, A. Slonchak, D. ¦cieglińska, Joanna Rzeszowska-Wolny. |
| ¬ródło: | W: Abstracts of the Congress of Biochemistry and Cell Biology. 43rd Meeting of the Polish Biochemical Society and 10th Conference of Polish Cell Biology Society, Olsztyn, Poland, September 7th-11st, 2008. Warszawa : [b.w.], 2008, s. 299 |
| Seria: | (Acta Biochimica Polonica ; vol. 55, suppl. 3 0001-527X) |
| Słowa kluczowe polskie: | S-transferaza glutationu ; GST ; ekspresja genów |
| Słowa kluczowe angielskie: | glutathione S-transferase ; GST ; gene expression |
| Typ publikacji: | K |
| Język publikacji: | ENG |
| Zasieg terytorialny: | K |
| Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
| Dostęp on-line: | |