Nr opisu: | 0000131326 |
Tytuł oryginału: | BioTest - remote platform for hypothesis testing and analysis of biomedical data. |
Autorzy: | Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, Roman Jaksik, Aleksander Płaczek, Aleksandra Helena Gruca, Sebastian Student, Damian Borys, Dariusz Mrozek, Krzysztof Fujarewicz, Andrzej ¦wierniak. |
¬ródło: | W: Current trends in biomedical engineering and bioimages analysis. Proceedings of the 21st Polish Conference on Biocybernetics and Biomedical Engineering, Zielona Góra, Poland, 25-27 September 2019. Eds.: Józef Korbicz, Roman Maniewski, Krzysztof Patan, Marek Kowal. Cham : Springer, 2020, s. 152-165, bibliogr. 22 poz. |
ISBN: | 978-3-030-29884-5978-3-030-29885-2 |
Seria: | (Advances in Intelligent Systems and Computing ; vol. 1033 2194-5357) |
Punktacja MNiSW: | 20.000 |
Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
Bazy indeksuj±ce publikację: | Springer; Scopus; Web of Science |
DOI: | |
Słowa kluczowe polskie: | bioinformatyka ; analiza danych biomedycznych ; integracja danych |
Słowa kluczowe angielskie: | bioinformatics ; biomedical data analysis ; data integration |
Typ publikacji: | RK |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Nr opisu: | 0000137505 |
Tytuł oryginału: | Classification of thyroid tumors based on mass spectrometry imaging of tissue microarrays a single-pixel approach |
Autorzy: | A. Kurczyk, M. Gawin, M. Chekan, Agata Wilk, Krzysztof Łakomiec, Grzegorz Mrukwa, Katarzyna Fr±tczak, Joanna Polańska, Krzysztof Fujarewicz, M. Pietrowska, P. Widlak. |
¬ródło: | -Int. J. Mol. Sci. 2020 vol. 21 iss. 17, s. 1-16, bibliogr. 40 poz. |
Impact Factor: | 4.556 |
Punktacja MNiSW: | 140.000 |
p-ISSN: | 1422-0067 |
e-ISSN: | 1422-0067 |
DOI: | |
Słowa kluczowe polskie: | rak tarczycy ; klasyfikacja molekularna ; obrazowanie molekularne ; bioinformatyka ; proteomika ; obrazowanie metod± spektrometrii mas ; biomarker |
Słowa kluczowe angielskie: | thyroid cancer ; molecular classification ; molecular imaging ; bioinformatics ; proteomics ; mass spectrometry imaging ; biomarker |
Typ publikacji: | A |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Informacje o dostępie open-access: | open-access-text-version: FINAL_PUBLISHED open-access-licence: CC-BY open-access-release-time: AT_PUBLICATION open-access-article-mode: OPEN_JOURNAL |
Dostęp on-line: | |
Nr opisu: | 0000135043 |
Tytuł oryginału: | Correction of the genes expression measurements based on the probes design features. |
Autorzy: | Krzysztof Puszyński, Anna Lalik, Roman Jaksik. |
¬ródło: | W: 2019 13th International Conference on Signal Processing and Communication Systems (ICSPCS), Gold Coast, Australia, December 16-18, 2019. Proceedings. Eds.: Tadeusz A. Wysocki & Beata J. Wysocki. Piscataway : Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2019, s. 1-6, bibliogr. 11 poz. |
ISBN: | 978-1-7281-2195-6978-1-7281-2194-9 |
Punktacja MNiSW: | 20.000 |
Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
Bazy indeksuj±ce publikację: | IEEE Xplore; INSPEC; Scopus |
DOI: | |
Słowa kluczowe polskie: | mikromacierz ; przetwarzanie sygnałów ; bioinformatyka ; pary GC |
Słowa kluczowe angielskie: | microarray ; signal processing ; bioinformatics ; GC pairs |
Typ publikacji: | RK |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Dostęp on-line: | |
Nr opisu: | 0000135021 |
Tytuł oryginału: | Nucleotide composition bias in high throughput gene expression measurement methods. |
Autorzy: | Roman Jaksik, Anna Lalik, Krzysztof Puszyński. |
¬ródło: | W: 2019 13th International Conference on Signal Processing and Communication Systems (ICSPCS), Gold Coast, Australia, December 16-18, 2019. Proceedings. Eds.: Tadeusz A. Wysocki & Beata J. Wysocki. Piscataway : Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2019, s. 1-6, bibliogr. 35 poz. |
ISBN: | 978-1-7281-2195-6978-1-7281-2194-9 |
Punktacja MNiSW: | 20.000 |
Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,5 |
Bazy indeksuj±ce publikację: | IEEE Xplore; INSPEC; Scopus |
DOI: | |
Słowa kluczowe polskie: | sekwencjonowanie RNA ; mikromacierz oligonukleotydowa ; bioinformatyka ; wykrywanie genów o zróżnicowanej ekspresji |
Słowa kluczowe angielskie: | RNA sequencing ; oligonucleotide microarray ; bioinformatics ; detection of differentially expressed genes |
Typ publikacji: | RK |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Dostęp on-line: | |
Nr opisu: | 0000115861 |
Tytuł oryginału: | Orchestrating task execution in Cloud4PSi for scalable processing of macromolecular data of 3D protein structures. |
Autorzy: | Dariusz Mrozek, K. Kłapciński, Bożena Małysiak-Mrozek. |
¬ródło: | W: Intelligent information and database systems. 9th Asian Conference, ACIIDS 2017, Kanazawa, Japan, April 3-5, 2017. Proceedings. Pt. 2. Eds. Ngoc Thanh Nguyen, Satoshi Tojo, Le Minh Nguyen, Bogdan Trawiński. Cham : Springer International Publishing, 2017, s. 723-732, bibliogr. 21 poz. |
ISBN: | 978-3-319-54429-8978-3-319-54430-4 |
Seria: | (Lecture Notes in Computer Science ; vol. 10192 Lecture Notes in Artificial Intelligence ; 0302-9743) |
Punktacja MNiSW: | 20.000 |
Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,6 |
Bazy indeksuj±ce publikację: | Springer; Scopus; Web of Science |
DOI: | |
Słowa kluczowe polskie: | bioinformatyka ; białko ; pozycjonowanie ; cloud computing ; harmonogramowanie ; Microsoft Azure ; struktura 3D białek ; parameter sweep |
Słowa kluczowe angielskie: | bioinformatics ; protein ; alignment ; cloud computing ; scheduling ; Microsoft Azure ; 3D protein structure ; parameter sweep |
Typ publikacji: | RK |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Nr opisu: | 0000115872 |
Tytuł oryginału: | Scalability of a genomic data analysis in the BioTest platform. |
Autorzy: | Krzysztof Psiuk-Maksymowicz, Dariusz Mrozek, Roman Jaksik, Damian Borys, Krzysztof Fujarewicz, Andrzej ¦wierniak. |
¬ródło: | W: Intelligent information and database systems. 9th Asian Conference, ACIIDS 2017, Kanazawa, Japan, April 3-5, 2017. Proceedings. Pt. 2. Eds. Ngoc Thanh Nguyen, Satoshi Tojo, Le Minh Nguyen, Bogdan Trawiński. Cham : Springer International Publishing, 2017, s. 741-752, bibliogr. 21 poz. |
ISBN: | 978-3-319-54429-8978-3-319-54430-4 |
Seria: | (Lecture Notes in Computer Science ; vol. 10192 Lecture Notes in Artificial Intelligence ; 0302-9743) |
Punktacja MNiSW: | 20.000 |
Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,7 |
Bazy indeksuj±ce publikację: | Springer; Scopus; Web of Science |
DOI: | |
Słowa kluczowe polskie: | bioinformatyka ; skalowalno¶ć ; platforma obliczeniowa ; klaster HPC ; workload manager ; analiza danych NGS |
Słowa kluczowe angielskie: | bioinformatics ; scalability ; computational platform ; HPC cluster ; workload manager ; NGS data analysis |
Typ publikacji: | RK |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Nr opisu: | 0000116067 |
Tytuł oryginału: | Accelerating 3D protein structure similarity searching on Microsoft Azure cloud with local replicas of macromolecular data. |
Autorzy: | Dariusz Mrozek, T. Kutyła, Bożena Małysiak-Mrozek. |
¬ródło: | W: Parallel processing and applied mathematics. 11th International Conference, PPAM 2015, Krakow, Poland, September 6-9, 2015. Revised Selected Papers. Pt. 2. Eds.:Roman Wyrzykowski, Ewa Deelman, Jack Dongarra, Konrad Karczewski, Jacek Kitowski, Kazimierz Wiatr. Berlin : Springer, 2016, s. 254-265, bibliogr. 24 poz. |
ISBN: | 978-3-319-32151-6978-3-319-32152-3 |
Seria: | (Lecture Notes in Computer Science ; vol. 9574 0302-9743) |
Liczba arkuszy wydawniczych: | 0,8 |
Bazy indeksuj±ce publikację: | Web of Science; Scopus; Springer |
DOI: | |
Słowa kluczowe polskie: | bioinformatyka ; białko ; struktura 3D białek ; wyszukiwanie podobieństw ; pozycjonowanie ; superpozycja ; chmura obliczeniowa ; obliczenia równoległe ; system równoległy ; skalowalno¶ć ; Microsoft Azure |
Słowa kluczowe angielskie: | bioinformatics ; protein ; 3D protein structure ; similarity searching ; alignment ; superposition ; cloud computing ; parallel computing ; parallel system ; scalability ; Microsoft Azure |
Typ publikacji: | RK |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Nr opisu: | 0000071605 |
Tytuł oryginału: | Fast and accurate similarity searching of biopolimer sequences with GPU and CUDA. |
Autorzy: | Ryszard* Pawłowski, Bożena Małysiak-Mrozek, Stanisław Kozielski, Dariusz Mrozek. |
¬ródło: | W: Algorithms and architectures for parallel processing. ICA3PP 2011. 11th International conference, Melbourne, Australia, October 24-26, 2011. Proceedings. Pt 1. Eds: Y. Xiang [et al.]. Berlin : Springer, 2011, s. 231-243, bibliogr. 13 poz. |
Seria: | (Lecture Notes in Computer Science ; vol. 7016 0302-9743) |
DOI: | |
Słowa kluczowe polskie: | bioinformatyka ; DNA ; białka ; dopasowanie sekwencji ; obliczenia równoległe ; GPU ; CUDA |
Słowa kluczowe angielskie: | bioinformatics ; DNA ; proteins ; sequence alignment ; parallel computing ; GPU ; CUDA |
Typ publikacji: | RK |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Dostęp on-line: | |
Nr opisu: | 0000056704 |
Tytuł oryginału: | Class prediction and pattern discovery in microarray data. Artificial intelligence and algebraic methods. |
Autorzy: | Andrzej ¦wierniak, Krzysztof Fujarewicz, Krzysztof Simek, M. ¦wierniak. |
¬ródło: | W: First Asian Conference on Intelligent Information and Database Systems. ACIIDS 2009, Dong Hoi, Vietnam, 1-3 April 2009. Ed. Ngoc Thanh Nguyen, Huynh Phan Nguyen, Adam Grzech. Piscataway : Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2009, s. 57-60, bibliogr. 16 poz. |
Słowa kluczowe polskie: | techniki inteligentne ; bioinformatyka ; DNA ; mikromacierz ; data mining |
Słowa kluczowe angielskie: | intelligent techniques ; bioinformatics ; DNA ; microarray ; data mining |
Typ publikacji: | RK |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Dostęp on-line: | |
Nr opisu: | 0000056760 |
Tytuł oryginału: | The EDML format to exchange energy profiles of protein molecular structures. |
Autorzy: | Dariusz Mrozek, Bożena Małysiak-Mrozek, Stanisław Kozielski, S. Górczyńska-Kosiorz. |
¬ródło: | W: Emerging intelligent computing technology and applications. 5th International Conference on Intelligent Computing. ICIC 2009, Ulsan, South Korea, September 16-19, 2009. Proceedings. Eds: Huang De-Shuang [et al.]. Berlin : Springer, 2009, s. 146-157, bibliogr. 24 poz. |
Seria: | (Lecture Notes in Computer Science ; vol. 5754 0302-9743) |
Słowa kluczowe polskie: | bioinformatyka ; struktura białka ; profil energetyczny ; XML ; baza danych |
Słowa kluczowe angielskie: | bioinformatics ; protein structure ; energy profile ; XML ; database |
Typ publikacji: | U |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | Z |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Nr opisu: | 0000022344 |
Tytuł oryginału: | Bioinformatyczne bazy danych - rola, miejsce i klasyfikacja. |
Autorzy: | Dariusz Mrozek, Bożena Małysiak. |
¬ródło: | W: Bazy danych. Struktury, algorytmy, metody. Praca zbiorowa. [T. 2]: Wybrane technologie i zastosowania. Pod red. Stanisława Kozielskiego [i in.]. Warszawa : Wydaw. Komunikacji i ٱczno¶ci, 2006, s. 107-116, bibliogr. 47 poz. |
Słowa kluczowe polskie: | bioinformatyka ; biologia ; baza danych |
Słowa kluczowe angielskie: | bioinformatics ; biology ; database |
Typ publikacji: | U |
Język publikacji: | POL |
Zasieg terytorialny: | K |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Lokalizacja ¬ródła: | P¦l. sygn. MgCzO 116433 |
Nr opisu: | 0000014698 |
Tytuł oryginału: | Information processing in bioinformatics database systems - mirror-based architecture and approximate search. |
Autorzy: | Dariusz Mrozek, Bożena Małysiak, Jacek* Fr±czek. |
¬ródło: | W: Proceedings of the International Conference on Engineering Education. ICEE'2005. Global education interlink, Gliwice, Poland, July 25-29, 2005. Vol. 2. Eds: Jerzy Mo¶ciński, Marcin Maci±żek. Gliwice : Silesian University of Technology, 2005, s. 535-540, bibliogr. 28 poz. |
Uwagi: | Toż na CD |
Słowa kluczowe polskie: | architektura ; bioinformatyka ; baza danych ; wyszukiwanie |
Słowa kluczowe angielskie: | architecture ; bioinformatics ; database ; search |
Typ publikacji: | RK |
Język publikacji: | ENG |
Zasieg terytorialny: | K |
Afiliacja: | praca afiliowana w P¦l. |
Lokalizacja ¬ródła: | P¦l. sygn. Cz.01 112984, Cz.01 E-35 |