Wynik wyszukiwania
Zapytanie: 3D PROTEIN STRUCTURE
Liczba odnalezionych rekordów: 11



Przej¶cie do opcji zmiany formatu | Wy¶wietlenie wyników w wersji do druku | Pobranie pliku do edytora | Przesłanie wyników do modułu analizy | excel | Nowe wyszukiwanie
1/11
Nr opisu: 0000124867
Tytuł oryginału: High-throughput and scalable protein function identification with Hadoop and Map-only pattern of the MapReduce processing model
Autorzy: Dariusz Mrozek, Marek Suwała, Bożena Małysiak-Mrozek.
¬ródło: -Knowl. Inf. Syst. 2019 vol. 60 iss. 1, s. 145-178, bibliogr. 50 poz.
Impact Factor: 2.397
Punktacja MNiSW: 100.000
p-ISSN: 0219-1377
e-ISSN: 0219-3116
DOI:
Słowa kluczowe polskie: bioinformatyka ; Big Data ; białka ; obliczenia skalowalne ; MapReduce ; struktura białka 3D ; chmura obliczeniowa
Słowa kluczowe angielskie: bioinformatics ; Big Data ; proteins ; scalable computations ; MapReduce ; 3D protein structure ; cloud computing
Typ publikacji: A
Język publikacji: ENG
Zasieg terytorialny: Z
Afiliacja: praca afiliowana w P¦l.
Informacje o dostępie open-access: open-access-text-version: FINAL_AUTHOR open-access-licence: CC-BY open-access-release-time: BEFORE_PUBLICATION open-access-article-mode: OPEN_JOURNAL
Dostęp on-line:


2/11
Nr opisu: 0000130912
Tytuł oryginału: Protein construction-based data partitioning scheme for alignment of protein macromolecular structures through distributed querying in federated databases
Autorzy: Dariusz Mrozek, J. Kwiendacz, Bożena Małysiak-Mrozek.
¬ródło: -IEEE Trans. Nanobiosci. 2019 in press, s. 1-15, bibliogr. 47 poz.
Uwagi: Article in press
Impact Factor: 1.927
Punktacja MNiSW: 70.000
p-ISSN: 1536-1241
e-ISSN: 1558-2639
Słowa kluczowe polskie: bioinformatyka ; białka ; sfederowana baza danych ; partycjonowanie danych ; struktura przestrzenna białka ; wyszukiwanie podobieństw ; dostosowanie struktury ; zapytanie rozproszone
Słowa kluczowe angielskie: bioinformatics ; proteins ; federated database ; data partitioning ; 3D protein structure ; similarity searching ; structural alignment ; distributed querying
Typ publikacji: A
Język publikacji: ENG
Zasieg terytorialny: Z
Afiliacja: praca afiliowana w P¦l.
Informacje o dostępie open-access: open-access-text-version: FINAL_PUBLISHED open-access-licence: CC-BY open-access-release-time: AT_PUBLICATION open-access-article-mode: OPEN_JOURNAL
Dostęp on-line:


3/11
Nr opisu: 0000125426
Tytuł oryginału: Efficient 3D protein structure alignment on large Hadoop clusters in Microsoft Azure cloud.
Autorzy: Bożena Małysiak-Mrozek, Paweł Daniłowicz, Dariusz Mrozek.
¬ródło: W: Beyond databases, architectures and structures. Facing the challenges of data proliferation and growing variety. 14th International conference, BDAS 2018 held at the 24th IFIP World Computer Congress, WCC 2018, Poznan, Poland, September 18-20, 2018. Proceedings. Eds. Stanisław Kozielski, Dariusz Mrozek, Paweł Kasprowski, Bożena Małysiak-Mrozek, Daniel Kostrzewa. Cham : Springer, 2018, s. 33-46, bibliogr. 33 poz.
ISBN: 978-3-319-99986-9978-3-319-99987-6
Seria: (Communications in Computer and Information Science ; vol. 928 1865-0929)
Liczba arkuszy wydawniczych: 0,8
Bazy indeksuj±ce publikację: Springer; Scopus; Web of Science
DOI:
Słowa kluczowe polskie: białko ; struktura przestrzenna białka ; bioinformatyka strukturalna ; dostosowanie struktury ; wyszukiwanie podobieństw ; Hadoop ; MapReduce ; chmura obliczeniowa ; Microsoft Azure
Słowa kluczowe angielskie: protein ; 3D protein structure ; structural bioinformatics ; structural alignment ; similarity searching ; Hadoop ; MapReduce ; cloud computing ; Microsoft Azure
Typ publikacji: RK
Język publikacji: ENG
Zasieg terytorialny: Z
Afiliacja: praca afiliowana w P¦l.
Dostęp on-line:


4/11
Nr opisu: 0000124823
Tytuł oryginału: In-memory management system for 3D protein macromolecular structures
Autorzy: Bożena Małysiak-Mrozek, Kamil* Żur, Dariusz Mrozek.
¬ródło: -Curr. Proteomics 2018 vol. 15 iss. 3, s. 175-189, bibliogr. 59 poz.
Impact Factor: 0.768
Punktacja MNiSW: 15.000
p-ISSN: 1570-1646
e-ISSN: 1875-6247
DOI:
Słowa kluczowe polskie: baza danych ; baza danych rezyduj±ca w pamięci ; system zarz±dzania ; białko ; struktura 3D białek ; bioinformatyka strukturalna
Słowa kluczowe angielskie: database ; in-memory database ; management system ; protein ; 3D protein structure ; structural bioinformatics
Typ publikacji: A
Język publikacji: ENG
Zasieg terytorialny: Z
Afiliacja: praca afiliowana w P¦l.


5/11
Nr opisu: 0000115861
Tytuł oryginału: Orchestrating task execution in Cloud4PSi for scalable processing of macromolecular data of 3D protein structures.
Autorzy: Dariusz Mrozek, K. Kłapciński, Bożena Małysiak-Mrozek.
¬ródło: W: Intelligent information and database systems. 9th Asian Conference, ACIIDS 2017, Kanazawa, Japan, April 3-5, 2017. Proceedings. Pt. 2. Eds. Ngoc Thanh Nguyen, Satoshi Tojo, Le Minh Nguyen, Bogdan Trawiński. Cham : Springer International Publishing, 2017, s. 723-732, bibliogr. 21 poz.
ISBN: 978-3-319-54429-8978-3-319-54430-4
Seria: (Lecture Notes in Computer Science ; vol. 10192 Lecture Notes in Artificial Intelligence ; 0302-9743)
Liczba arkuszy wydawniczych: 0,6
Bazy indeksuj±ce publikację: Springer; Scopus; Web of Science
DOI:
Słowa kluczowe polskie: bioinformatyka ; białko ; pozycjonowanie ; cloud computing ; harmonogramowanie ; Microsoft Azure ; struktura 3D białek ; parameter sweep
Słowa kluczowe angielskie: bioinformatics ; protein ; alignment ; cloud computing ; scheduling ; Microsoft Azure ; 3D protein structure ; parameter sweep
Typ publikacji: RK
Język publikacji: ENG
Zasieg terytorialny: Z
Afiliacja: praca afiliowana w P¦l.


6/11
Nr opisu: 0000116067
Tytuł oryginału: Accelerating 3D protein structure similarity searching on Microsoft Azure cloud with local replicas of macromolecular data.
Autorzy: Dariusz Mrozek, T. Kutyła, Bożena Małysiak-Mrozek.
¬ródło: W: Parallel processing and applied mathematics. 11th International Conference, PPAM 2015, Krakow, Poland, September 6-9, 2015. Revised Selected Papers. Pt. 2. Eds.:Roman Wyrzykowski, Ewa Deelman, Jack Dongarra, Konrad Karczewski, Jacek Kitowski, Kazimierz Wiatr. Berlin : Springer, 2016, s. 254-265, bibliogr. 24 poz.
ISBN: 978-3-319-32151-6978-3-319-32152-3
Seria: (Lecture Notes in Computer Science ; vol. 9574 0302-9743)
Liczba arkuszy wydawniczych: 0,8
Bazy indeksuj±ce publikację: Web of Science; Scopus; Springer
DOI:
Słowa kluczowe polskie: bioinformatyka ; białko ; struktura 3D białek ; wyszukiwanie podobieństw ; pozycjonowanie ; superpozycja ; chmura obliczeniowa ; obliczenia równoległe ; system równoległy ; skalowalno¶ć ; Microsoft Azure
Słowa kluczowe angielskie: bioinformatics ; protein ; 3D protein structure ; similarity searching ; alignment ; superposition ; cloud computing ; parallel computing ; parallel system ; scalability ; Microsoft Azure
Typ publikacji: RK
Język publikacji: ENG
Zasieg terytorialny: Z
Afiliacja: praca afiliowana w P¦l.


7/11
Nr opisu: 0000101625
Tytuł oryginału: Accelerating 3D protein structure similarity searching on Microsoft Azure cloud with local replicas of macromolecular data.
Autorzy: Dariusz Mrozek, T. Kutyła, Bożena Małysiak-Mrozek.
¬ródło: W: 11th International Conference on Parallel Processing & Applied Mathematics. PPAM 2015, Poland, Krakow, September 6-9, 2015. Book of abstracts. [B.m.] : [b.w.], 2015, s. 22
Słowa kluczowe polskie: bioinformatyka ; białka ; struktura 3D białek ; wyszukiwanie podobieństw ; chmura obliczeniowa ; obliczenia równoległe ; system równoległy ; skalowalno¶ć ; Microsoft Azure
Słowa kluczowe angielskie: bioinformatics ; proteins ; 3D protein structure ; similarity searching ; cloud computing ; parallel computing ; parallel system ; scalability ; Microsoft Azure
Typ publikacji: K
Język publikacji: ENG
Zasieg terytorialny: K
Afiliacja: praca afiliowana w P¦l.


8/11
Nr opisu: 0000105517
Tytuł oryginału: HDInsight4PSi: boosting performance of 3D protein structure similarity searching with HDInsight clusters in Microsoft Azure cloud
Autorzy: Dariusz Mrozek, P. Daniłowicz, Bożena Małysiak-Mrozek.
¬ródło: -Inf. Sci. 2015 vol. 349/350, s. 77-101, bibliogr. 62 poz.
Impact Factor: 3.364
Punktacja MNiSW: 45.000
p-ISSN: 0020-0255
e-ISSN: 1872-6291
DOI:
Słowa kluczowe polskie: bioinformatyka ; struktura 3D białek ; poszukiwanie podobieństwa ; Hadoop/MapReduce ; cloud computing ; Big Data
Słowa kluczowe angielskie: bioinformatics ; 3D protein structure ; similarity searching ; Hadoop/MapReduce ; cloud computing ; Big Data
Typ publikacji: A
Język publikacji: ENG
Zasieg terytorialny: Z
Afiliacja: praca afiliowana w P¦l.
Dostęp on-line:


9/11
Nr opisu: 0000104864
Tytuł oryginału: P3D-SQL: extending oracle PL/SQL capabilities towards 3D protein structure similarity searching.
Autorzy: Dariusz Mrozek, Bożena Małysiak-Mrozek, R. Adamek.
¬ródło: W: Bioinformatics and biomedical engineering. Third International Conference, IWBBIO 2015, Granada, Spain, April 15-17, 2015. Proceedings. Pt. 1. Eds.: Francisco Ortuno, Ignacio Rojas. Cham : Springer, 2015, s. 548-556, bibliogr. 14 poz.
ISBN: 978-3-319-16482-3978-3-319-16483-0
Seria: (Lecture Notes in Computer Science ; vol. 9043 Lecture Notes in Artificial Intelligence ; 0302-9743)
Liczba arkuszy wydawniczych: 0,5
Bazy indeksuj±ce publikację: Scopus
DOI:
Słowa kluczowe polskie: białka ; struktura 3D białek ; bioinformatyka strukturalna ; wyszukiwanie podobieństw ; dostosowanie struktury ; baza danych ; SQL ; relacyjna baza danych ; język zapytań
Słowa kluczowe angielskie: proteins ; 3D protein structure ; structural bioinformatics ; similarity searching ; structural alignment ; database ; SQL ; relational database ; query language
Typ publikacji: RK
Język publikacji: ENG
Zasieg terytorialny: Z
Afiliacja: praca afiliowana w P¦l.


10/11
Nr opisu: 0000104424
Tytuł oryginału: Scaling Ab initio predictions of 3D protein structures in microsoft azure cloud
Autorzy: Dariusz Mrozek, P. Gosk, Bożena Małysiak-Mrozek.
¬ródło: -J. Grid Comput. 2015 vol. 13 iss. 4, s. 561-585, bibliogr. 73 poz.
Impact Factor: 1.561
Punktacja MNiSW: 35.000
p-ISSN: 1570-7873
e-ISSN: 1572-9184
DOI:
Słowa kluczowe polskie: bioinformatyka ; białko ; struktura 3D białek ; przewidywanie struktury białka ; przewidywanie struktury trzeciorzędowej ; ab initio ; modelowanie struktury białka ; chmura obliczeniowa ; obliczenia rozproszone ; skalowalno¶ć ; Microsoft Azure
Słowa kluczowe angielskie: bioinformatics ; protein ; 3D protein structure ; protein structure prediction ; tertiary structure prediction ; ab initio ; protein structure modeling ; cloud computing ; distributed computing ; scalability ; Microsoft Azure
Typ publikacji: A
Język publikacji: ENG
Zasieg terytorialny: Z
Afiliacja: praca afiliowana w P¦l.
Informacje o dostępie open-access: open-access-licence: CC-BY
Dostęp on-line:


11/11
Nr opisu: 0000095827
Tytuł oryginału: Parallel implementation of 3D protein structure similarity searches using a GPU and the CUDA
Tytuł w wersji polskiej: Równoległa realizacja poszukiwania podobieństwa strukturalnego białek z użyciem procesorów graficznych GPU i architektury CUDA
Autorzy: Dariusz Mrozek, M. Brożek, Bożena Małysiak-Mrozek.
¬ródło: -J. Mol. Model. 2014 vol. 20 iss. 2, art. 2067 s. 1-17, bibliogr. 41 poz.
Impact Factor: 1.736
Punktacja MNiSW: 25.000
p-ISSN: 1610-2940
e-ISSN: 0948-5023
DOI:
Słowa kluczowe polskie: GPU ; CUDA ; programowanie równoległe ; dopasowanie struktury ; dostosowanie struktury ; porównanie struktury ; wyszukiwanie podobieństw ; struktura 3D białek
Słowa kluczowe angielskie: GPU ; CUDA ; parallel programming ; structure matching ; structure alignment ; structure comparison ; similarity searching ; 3D protein structure
Typ publikacji: A
Język publikacji: ENG
Zasieg terytorialny: Z
Afiliacja: praca afiliowana w P¦l.
Informacje o dostępie open-access: open-access-licence: CC-BY
Dostęp on-line:


stosuj±c format:
Nowe wyszukiwanie